26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0705 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0705  putative plasmid transfer protein  100 
 
 		 399 aa  800    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0106  TraF  54.39 
 
 		 400 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3221  putative plasmid transfer protein  48.8 
 
 		 415 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4584  conjugative transfer protein  41.38 
 
 		 436 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4636  conjugative transfer protein  41.38 
 
 		 436 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.403008  normal  0.321234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4585  conjugative transfer protein  41.38 
 
 		 436 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.774024 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4499  conjugative transfer protein  41.38 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4434  conjugative transfer protein  41.38 
 
 		 436 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.413402  hitchhiker  0.00000046474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0252  conjugative transfer protein  41.88 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4649  hypothetical protein  56.39 
 
 		 266 aa  308  8e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0051  putative plasmid transfer protein  42.01 
 
 		 396 aa  285  9e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000649628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0619  putative plasmid transfer protein  34.79 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0557  putative plasmid transfer protein  33.93 
 
 		 397 aa  229  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0529  putative plasmid transfer protein  32.68 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000622443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2920  hypothetical protein  36.15 
 
 		 380 aa  223  7e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.448898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3174  putative outer membrane or exported  31.84 
 
 		 397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0517  putative plasmid transfer protein  34.22 
 
 		 398 aa  205  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.359059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0674  hypothetical protein  31.71 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000817  hypothetical protein  33.24 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529615  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0502  hypothetical protein  32.8 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00214405  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000131  TraF-related protein  29.72 
 
 		 373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00236694  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05738  hypothetical protein  29.43 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4490  hypothetical protein  28.33 
 
 		 421 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4044  putative plasmid transfer protein  30.77 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3650  ribonuclease PH  24.81 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4405  hypothetical protein  24.48 
 
 		 509 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000142257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>