More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0595 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0595  putative capsular polysacharide biosynthesis transferase  100 
 
 
166 aa  333  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3549  putative capsular polysacharide biosynthesis transferase  84.94 
 
 
166 aa  290  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00933563  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3271  satase isoform II  41.03 
 
 
174 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4091  satase isoform II  39.19 
 
 
178 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4046  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.67 
 
 
182 aa  114  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7395  serine O-acetyltransferase  36.91 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6178  hexapaptide repeat-containing transferase  36.91 
 
 
176 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5910  hexapaptide repeat-containing transferase  36.91 
 
 
176 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.787175 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1357  satase isoform II  33.54 
 
 
176 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2296  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  40.67 
 
 
162 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0186762  normal  0.151552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01964  predicted acyl transferase  40 
 
 
162 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1599  transferase hexapeptide repeat containing protein  40 
 
 
162 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1174  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  40 
 
 
162 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2351  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  40 
 
 
162 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3255  serine O-acetyltransferase  35.57 
 
 
178 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1583  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  40 
 
 
162 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3216  serine O-acetyltransferase  35.57 
 
 
178 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1004  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  40 
 
 
162 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89582  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01953  hypothetical protein  40 
 
 
162 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2993  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  40 
 
 
162 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2239  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  40 
 
 
162 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2454  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  40 
 
 
162 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0245254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2340  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  41.67 
 
 
146 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.68727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2347  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  40 
 
 
162 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3267  serine O-acetyltransferase  35.92 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2672  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  37.33 
 
 
163 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  40.16 
 
 
184 aa  79  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1008  serine O-acetyltransferase  33.57 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  43.64 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1960  hexapeptide transferase family protein  34.44 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  34.65 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1817  serine O-acetyltransferase  31.43 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  37.14 
 
 
240 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1005  serine O-acetyltransferase  34.06 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.976696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  37.29 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1436  serine acetyltransferase CysE, putative  29.94 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.75 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  36.51 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  39.62 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1110  serine O-acetyltransferase  45.05 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0265752  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  39.81 
 
 
280 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2611  serine acetyltransferase  33.33 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.513784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3325  serine O-acetyltransferase  41.41 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000443093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2485  serine O-acetyltransferase  39.09 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105087  normal  0.0192954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3942  serine O-acetyltransferase  28.87 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  31.71 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4533  serine acetyltransferase  37.04 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.191412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2319  serine O-acetyltransferase  35.07 
 
 
273 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0101621  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  37.84 
 
 
258 aa  67.8  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17661  Serine acetyltransferase  35.77 
 
 
249 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0954  Serine O-acetyltransferase  38.83 
 
 
175 aa  67.4  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  37.38 
 
 
260 aa  67.4  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1957  serine O-acetyltransferase  36.7 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1321  serine O-acetyltransferase  31.1 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3570  Serine acetyltransferase-like protein  33.76 
 
 
208 aa  67.4  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220057  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0457  transferase hexapeptide, putative  35.04 
 
 
141 aa  67  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000034656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  39.09 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  39.09 
 
 
258 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0169  serine O-acetyltransferase  39.62 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000824701  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  37.84 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1165  serine O-acetyltransferase  36 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.701268  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  32.92 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1135  serine O-acetyltransferase  36 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.19 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  37.74 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  36 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2890  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1486  serine O-acetyltransferase  37.84 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.517534  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1382  serine O-acetyltransferase  36.67 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0271365  normal  0.022365 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4294  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.33 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1456  serine O-acetyltransferase  38.74 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000250331  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.81 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4354  hypothetical protein  35.33 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.372649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  40.91 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2426  serine O-acetyltransferase  37.84 
 
 
273 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.563474  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5090  Serine acetyltransferase-like  30.26 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  35.2 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  36.36 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  37.86 
 
 
245 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  35.96 
 
 
249 aa  65.1  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  37.86 
 
 
245 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  37.84 
 
 
273 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  37.84 
 
 
273 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  37.84 
 
 
273 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  35.96 
 
 
264 aa  65.1  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2468  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.75 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3060  O-acetylserine synthase  33.91 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.950914  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3788  hexapaptide repeat-containing transferase  36.63 
 
 
218 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  37.84 
 
 
273 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1129  serine O-acetyltransferase  33.83 
 
 
256 aa  64.3  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1845  serine acetyltransferase-like protein  31.65 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5019  acetyltransferase  38.33 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3291  serine O-acetyltransferase  35.45 
 
 
259 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.434355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  35.2 
 
 
242 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0586  serine O-acetyltransferase  34.33 
 
 
188 aa  63.9  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0228383  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2375  serine acetyltransferase  32.67 
 
 
188 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3107  serine O-acetyltransferase  33.55 
 
 
253 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000903584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2420  serine O-acetyltransferase  37.86 
 
 
244 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0922044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2873  Serine O-acetyltransferase  37.04 
 
 
273 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.78055  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  36.94 
 
 
273 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>