111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3505 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3505  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  205  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  54.64 
 
 		 377 aa  114  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  62.35 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  59.34 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  48.42 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  47.37 
 
 		 98 aa  97.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  97.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  65.71 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  48.98 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  47.31 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  45.74 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  46.74 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  47.83 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0096  hypothetical protein  42.71 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0075  hypothetical protein  42.11 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  35.48 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3705  hypothetical protein  32.94 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  42.5 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  34.09 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  41.82 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  38.71 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  41.38 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  31.25 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  36.9 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  36.84 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4180  acetyltransferase-like protein  38.03 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  32.99 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  36.36 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  44.23 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0155  acetyltransferase  33.71 
 
 		 93 aa  52.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  34.62 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0293  acetyltransferase-like protein  30.69 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  36.21 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  41.38 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  41.51 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  40.68 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  41.51 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  31.82 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0995  acetyltransferase  39.29 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03998  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  27.38 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3865  conserved hypothetical protein  27.38 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03959  hypothetical protein  27.38 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  35.09 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4368  hypothetical protein  29.41 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.337013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4681  hypothetical protein  29.41 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3900  hypothetical protein  29.41 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4595  hypothetical protein  29.41 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5642  hypothetical protein  29.41 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  35.09 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3304  hypothetical protein  31.34 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2928  acetyltransferase-like protein  35.23 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5016  hypothetical protein  34.48 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0775748  normal  0.0369444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  29.35 
 
 		 100 aa  48.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  41.07 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  39.62 
 
 		 111 aa  47.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  34.18 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  29.76 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  32.43 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  27 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2082  acetyltransferase  38.89 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5880  hypothetical protein  38.6 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.630682 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 		 95 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  35.62 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0652  hypothetical protein  32.93 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  35.14 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  40.79 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  37.25 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  32.56 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  35.85 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3734  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0465145  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  30.88 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  34.25 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0299  hypothetical protein  29.58 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 834 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  38.18 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3632  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17450  predicted acetyltransferase  35.59 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107922  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  33.96 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  31.03 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  29.89 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  35.85 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  35.85 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  35.85 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1740  hypothetical protein  35.48 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  45.45 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2548  hypothetical protein  35.85 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  37.74 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  30.67 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 96 aa  42  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  33.96 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  31.87 
 
 		 90 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>