129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4391 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  67.82 
 
 
110 aa  121  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  68.18 
 
 
96 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  68.97 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  66.67 
 
 
96 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  68.24 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  42.7 
 
 
93 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  42.7 
 
 
95 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  43.33 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  40.45 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  41.86 
 
 
93 aa  78.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4571  acetyltransferase-like protein  44.94 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017414  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  42.05 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  42.22 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  40.96 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  40.48 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  37.78 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  39.76 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  39.77 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  35.96 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  40.45 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  38.64 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5880  hypothetical protein  35.23 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.630682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  37.5 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  38.37 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  40.86 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  41.76 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  41.77 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  34.88 
 
 
100 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  34.57 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  32.95 
 
 
104 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  38.2 
 
 
114 aa  59.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  32.53 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2548  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0510  acetyltransferase-like protein  37.04 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  40.96 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  37.65 
 
 
93 aa  58.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  41.46 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  42.67 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  34.83 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  35.87 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  38.1 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  34.83 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  32.53 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  36.9 
 
 
834 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  32.58 
 
 
94 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  35.23 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  36.71 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  34.52 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  34.09 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  31.33 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0995  acetyltransferase  37.7 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  42.11 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0652  hypothetical protein  30.68 
 
 
98 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  32.91 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  32.91 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  32.91 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  30.77 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  34.62 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  32.1 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0789  hypothetical protein  35.56 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03020  predicted acetyltransferase  36.47 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  34.57 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  37.65 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0713  acetyltransferase  36.36 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  29.87 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  34.62 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  34.62 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  34.62 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  32.58 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  34.62 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  26.58 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  28.57 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  32.94 
 
 
112 aa  48.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  31.46 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17450  predicted acetyltransferase  32.32 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107922  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  34.57 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  34.57 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  27.5 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3632  hypothetical protein  34.52 
 
 
111 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  28.4 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 
91 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3723  hypothetical protein  35.14 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  32.18 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  30.77 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  27.59 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  30.59 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  24.05 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3304  hypothetical protein  38.6 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  24.05 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  32.05 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  24.36 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0164  hypothetical protein  34.62 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10410  predicted acetyltransferase  30.85 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0185042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>