22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2974 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2974  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 634 aa  1283    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.413314  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0237  SNF2-related protein  28.47 
 
 		 990 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  30.89 
 
 		 986 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  46.67 
 
 		 982 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  28.32 
 
 		 952 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  34.33 
 
 		 919 aa  47.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  42.22 
 
 		 952 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  30.77 
 
 		 952 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  30.77 
 
 		 952 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  32.84 
 
 		 952 aa  47.8  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  30.7 
 
 		 957 aa  47.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  34.33 
 
 		 968 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  29.17 
 
 		 954 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  38.57 
 
 		 950 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  27.52 
 
 		 933 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  25 
 
 		 971 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  26.77 
 
 		 945 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.25 
 
 		 949 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  30.3 
 
 		 973 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  28 
 
 		 969 aa  44.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  30.93 
 
 		 1046 aa  44.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  27.78 
 
 		 933 aa  43.9  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>