More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0862 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2061  aspartokinase  77.94 
 
 		 412 aa  641    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.227299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1849  aspartate kinase  87.98 
 
 		 419 aa  735    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3191  aspartate kinase  77.46 
 
 		 412 aa  662    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0636  aspartate kinase  87.26 
 
 		 419 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0498  aspartate kinase  87.98 
 
 		 419 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366794  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0862  aspartate kinase  100 
 
 		 418 aa  853    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1934  aspartate kinase  76.74 
 
 		 412 aa  626  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.167611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2504  aspartate kinase  62.73 
 
 		 424 aa  511  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3526  aspartate kinase  62.73 
 
 		 424 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.566908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  62.5 
 
 		 406 aa  508  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1034  aspartate kinase  60.65 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654239  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  61.18 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3001  aspartate kinase  60.65 
 
 		 424 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0891  aspartate kinase  60.48 
 
 		 411 aa  495  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382577 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1802  aspartate kinase  60.65 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0701255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0135  aspartate kinase  60.38 
 
 		 411 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0420777  normal  0.197945 
 
 
-
 
NC_004310  BR1871  aspartate kinase  60.42 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3818  aspartate kinase  62.76 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  60.58 
 
 		 405 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4746  aspartate kinase  59.67 
 
 		 411 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0110  aspartate kinase  58.95 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1743  aspartate kinase  59.39 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557086  normal  0.669364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3957  aspartate kinase  61.11 
 
 		 424 aa  481  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0379  aspartate kinase  59.2 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0472  aspartate kinase  58.63 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2625  aspartate kinase  58.64 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1562  aspartate kinase  59.43 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4503  aspartate kinase  57.58 
 
 		 418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0896  aspartate kinase  57.76 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.434223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7602  aspartate kinase  58.59 
 
 		 418 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0132  aspartate kinase  58.67 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0950  aspartate kinase  59.62 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0921  aspartate kinase  57.52 
 
 		 411 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0958  aspartate kinase  57.52 
 
 		 411 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859872  normal  0.0328142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0514  aspartate kinase  57.55 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0514405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0077  aspartate kinase  57.55 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.0840427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0608  aspartate kinase  58.02 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134577  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0099  aspartate kinase  57.31 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.211168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2144  aspartate kinase  55.69 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0884042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3304  aspartate kinase  54.12 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0250326  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  55.42 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  52.87 
 
 		 408 aa  421  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  50.59 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  50.59 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  52.27 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  50.72 
 
 		 406 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  51.31 
 
 		 411 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  51.07 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  52.27 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  52.27 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  52.03 
 
 		 409 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  51.07 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  52.03 
 
 		 411 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  51.9 
 
 		 412 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  52.14 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  52.61 
 
 		 424 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  50.96 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  51.29 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  51.54 
 
 		 413 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  51.32 
 
 		 409 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  52.39 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  50.12 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  52.64 
 
 		 416 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  51.44 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  51.08 
 
 		 410 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  51.57 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  51.57 
 
 		 408 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  52.16 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  50.48 
 
 		 409 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  51.08 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  52.16 
 
 		 408 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  51.55 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1674  aspartate kinase  50.23 
 
 		 422 aa  395  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  52.16 
 
 		 408 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  51.2 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  52.87 
 
 		 412 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  50.82 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  50.83 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  51.08 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  51.08 
 
 		 409 aa  388  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  51.91 
 
 		 409 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  48.92 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  48.92 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  49.76 
 
 		 411 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  50.48 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  48.46 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  48.67 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  51.42 
 
 		 416 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1106  aspartate kinase  51.42 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.736404  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  49.53 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1207  aspartate kinase  50.71 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629425  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  50 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1171  aspartate kinase  50.94 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000593821  normal  0.758494 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  52.28 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5380  aspartate kinase  50.47 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197228  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6003  aspartate kinase  50.47 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  50.47 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1979  aspartate kinase  50.47 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2093  aspartate kinase  50.47 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  50.24 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>