More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2671 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
193 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2392  hypothetical protein  39.58 
 
 
206 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.823369  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1944  methyltransferase type 11  34.68 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
208 aa  92.4  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.54 
 
 
205 aa  89  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  29.88 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
231 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  30.49 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  27.15 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.3 
 
 
243 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
226 aa  61.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
223 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  30.87 
 
 
208 aa  61.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
269 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.55 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887672  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0348  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.3 
 
 
243 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.43472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  27.74 
 
 
271 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  27.81 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0333  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.3 
 
 
243 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744081  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
242 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  28.79 
 
 
243 aa  57.8  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.91 
 
 
235 aa  57.8  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.83 
 
 
254 aa  57.8  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0458  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.55 
 
 
243 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.886741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
274 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  32.33 
 
 
168 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.24 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.34 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0649  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.24 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.08 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.06 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.55 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2146  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 
176 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.56 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  30.26 
 
 
1014 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0374  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.55 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  27.74 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  27.69 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 
269 aa  55.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  34.11 
 
 
251 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 
245 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
189 aa  55.1  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.32 
 
 
243 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3644  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.01 
 
 
243 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.423854  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1251  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
216 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000494899  normal  0.377886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 
273 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
226 aa  54.7  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 
373 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0667  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0186  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0844  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
254 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0683  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.54 
 
 
248 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  30.16 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2759  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0781  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.83 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2760  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793539  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0567  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
266 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
288 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2245  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.14 
 
 
265 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.45 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.08 
 
 
362 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.37 
 
 
249 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2650  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.067766  normal  0.282604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
256 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2783  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1003  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00822165  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  26.83 
 
 
267 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.21 
 
 
209 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  29.01 
 
 
265 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.01 
 
 
249 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>