20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0517 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0517  PAS domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  344  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00238145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4048  putative PAS/PAC sensor protein  44.03 
 
 		 168 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.606719  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01770  putative PAS/PAC sensor protein  39.75 
 
 		 584 aa  111  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  33.56 
 
 		 571 aa  91.3  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0839  putative PAS/PAC sensor protein  31.68 
 
 		 569 aa  85.1  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1585  putative PAS/PAC sensor protein  32.67 
 
 		 573 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000290099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0655  putative PAS/PAC sensor protein  32.91 
 
 		 580 aa  77  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  32.41 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0752  putative PAS/PAC sensor protein  30.92 
 
 		 559 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.801139  hitchhiker  0.0000000000202467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0426  putative PAS/PAC sensor protein  28.67 
 
 		 556 aa  63.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  32.71 
 
 		 574 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.28 
 
 		 521 aa  61.2  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.28 
 
 		 521 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000641444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  34.26 
 
 		 577 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.89 
 
 		 542 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0494  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.72 
 
 		 519 aa  53.9  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.44 
 
 		 550 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1846  putative PAS/PAC sensor protein  27.16 
 
 		 572 aa  47.4  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  29.63 
 
 		 461 aa  45.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 865 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>