25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1565 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1565  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1288  hypothetical protein  49.02 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.758563  normal  0.840591 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0398  hypothetical protein  45.1 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.110353  normal  0.968309 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0206  hypothetical protein  51.85 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000000527651  normal  0.0573438 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1614  hypothetical protein  51.61 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0101786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.95 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.58 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2779  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  50 
 
 		 78 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0931  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.33 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3015  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.27 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2950  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.71 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1951  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.21 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3064  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.28 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0118  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  42.25 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00072564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1739  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.67 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0764  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.48 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1241  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.33 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0141  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.95 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2110  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.44 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.305152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1283  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.27 
 
 		 75 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0388  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.984781  hitchhiker  0.00000000422403 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0177  hydrogenase expression/formation protein  37.97 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0463  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.49 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604449  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.85 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0268  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.09 
 
 		 78 aa  40  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.123557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>