75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0929 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0929  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 
296 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1374  phosphoesterase domain-containing protein  66.67 
 
 
295 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.196135  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0829  phosphoesterase domain-containing protein  66.55 
 
 
296 aa  395  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0527609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1944  phosphoesterase domain-containing protein  63.7 
 
 
296 aa  381  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.754503  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1715  phosphoesterase domain-containing protein  28.31 
 
 
317 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0654  phosphoesterase, DHHA1  32.82 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0418861  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0778  phosphoesterase  59.42 
 
 
76 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  25 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  26.32 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  28.4 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1122  phosphoesterase RecJ domain protein  27.86 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00100045  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1257  phosphoesterase domain-containing protein  26.76 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0709  phosphoesterase domain-containing protein  28.82 
 
 
338 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1429  phosphoesterase domain-containing protein  27.84 
 
 
338 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1246  phosphoesterase domain-containing protein  28.07 
 
 
335 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631714  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0459  phosphoesterase RecJ domain protein  26.13 
 
 
320 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  24.77 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1231  phosphoesterase domain-containing protein  28.47 
 
 
326 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  22.86 
 
 
317 aa  59.7  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  23.9 
 
 
333 aa  58.9  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3674  phosphoesterase RecJ domain protein  28.21 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  23.15 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  24.16 
 
 
314 aa  56.2  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  27.22 
 
 
325 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  25.38 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0574  phosphoesterase domain-containing protein  23.8 
 
 
335 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  21.34 
 
 
344 aa  53.1  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  25.24 
 
 
339 aa  52.8  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  23.91 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  27.36 
 
 
330 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  27.13 
 
 
904 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  21.36 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.23 
 
 
769 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  24.1 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  27.46 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  28.72 
 
 
330 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  29.96 
 
 
875 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0818  phosphoesterase domain-containing protein  25.52 
 
 
315 aa  49.7  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0241  phosphoesterase RecJ domain protein  25.17 
 
 
314 aa  49.3  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.126472  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  28.14 
 
 
898 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  29.55 
 
 
888 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0265  phosphoesterase domain-containing protein  24.54 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0492  phosphoesterase RecJ domain protein  24.43 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  22 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  22.8 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2067  phosphoesterase domain-containing protein  27.74 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0130245  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2084  phosphoesterase, RecJ-like protein  27.74 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  25.08 
 
 
366 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2130  phosphoesterase domain-containing protein  27.74 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  22.6 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1527  phosphoesterase domain-containing protein  25.39 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.438361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  28.17 
 
 
902 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  25 
 
 
863 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12852  hypothetical protein  27.78 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356507  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  25.17 
 
 
872 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  27.07 
 
 
875 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  23.67 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0539  phosphoesterase RecJ domain protein  22.22 
 
 
336 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000146173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3224  phosphoesterase RecJ domain protein  27.22 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1590  DHH domain-containing protein  25.36 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00964569  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  24.84 
 
 
487 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3649  hypothetical protein  22.37 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.61 
 
 
892 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.25 
 
 
873 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  28.69 
 
 
875 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0989  phosphoesterase, RecJ-like protein  24.66 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  23.83 
 
 
511 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  24.58 
 
 
863 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2316  phosphoesterase domain-containing protein  26.92 
 
 
335 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1414  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.72 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  25.31 
 
 
486 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  24.81 
 
 
1077 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0142  DHH phosphoesterase family protein, putative  21.74 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.457819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  30.45 
 
 
880 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  25.97 
 
 
874 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>