26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1933 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1933  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  135  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  37.31 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  38.81 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.1 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  35.38 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  38.71 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  30.77 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  30 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1608  sulfur transfer protein  37.31 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.85 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  33.85 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  42 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0283  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  31.75 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>