40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1268 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1268  response regulator receiver protein  100 
 
 		 513 aa  1063    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  49.7 
 
 		 561 aa  528  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  31 
 
 		 538 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 540 aa  244  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  20.46 
 
 		 560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  25.34 
 
 		 546 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  22.2 
 
 		 546 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  20.82 
 
 		 551 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 403 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  22.29 
 
 		 549 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  24.78 
 
 		 535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  22.77 
 
 		 547 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  21.33 
 
 		 535 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  21.33 
 
 		 535 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  26.5 
 
 		 449 aa  94.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  21.13 
 
 		 535 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  22.57 
 
 		 537 aa  92.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  20.49 
 
 		 535 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  23.95 
 
 		 572 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  21.76 
 
 		 534 aa  87  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  20.64 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  20.56 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  24 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 549 aa  73.6  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01904  CheY-like receiver protein  23.81 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.466885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0947  response regulator receiver protein  22.34 
 
 		 539 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00824863  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  23.46 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  21.29 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  21.54 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  20.15 
 
 		 555 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  21.91 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  21.47 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  22.44 
 
 		 587 aa  51.2  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  31.78 
 
 		 402 aa  50.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0819  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.11 
 
 		 246 aa  47.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1684  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.248292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 860 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1213  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.91 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 531 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0315  putative response regulator  22.58 
 
 		 576 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.601639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>