30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0537 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0537  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 391 aa  806    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4972  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.6 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3412  hypothetical protein  57.36 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1964  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  55.5 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02779  putative orphan protein  48.62 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.313738  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  47.45 
 
 		 1844 aa  338  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.96 
 
 		 672 aa  335  5.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0922  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.24 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.78 
 
 		 1016 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15310  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  47.92 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.741887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2941  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.92 
 
 		 396 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  48.83 
 
 		 705 aa  302  6.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06470  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.21 
 
 		 411 aa  296  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.99 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.53 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.530599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1108  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.86 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1073  protein of unknown function DUF1555  39.3 
 
 		 457 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04860  phytase  41.28 
 
 		 410 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3484  hypothetical protein  36.88 
 
 		 464 aa  230  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0729061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3003  hypothetical protein  36.4 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3335  hypothetical protein  36.69 
 
 		 463 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000697045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05881  phytase  33.1 
 
 		 454 aa  212  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000275  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  32.32 
 
 		 454 aa  209  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0082  hypothetical protein  31.68 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431101  normal  0.216389 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2523  hypothetical protein  31.76 
 
 		 350 aa  164  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3763  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.93 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0125  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.91 
 
 		 279 aa  153  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2519  hypothetical protein  29.23 
 
 		 309 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0860  hypothetical protein  28.94 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6804  phytase  47.27 
 
 		 98 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>