61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1844 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  796    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  72.49 
 
 		 389 aa  604  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  75.84 
 
 		 387 aa  595  1e-169  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  74.55 
 
 		 387 aa  587  1e-166  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  50.64 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  43.51 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  40.97 
 
 		 357 aa  238  9e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  38.52 
 
 		 351 aa  226  6e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.61 
 
 		 370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  27.68 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  27.95 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  27.54 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  28.88 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  28.41 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  29.79 
 
 		 363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  28.5 
 
 		 365 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  27.57 
 
 		 367 aa  133  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  27.85 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  30.03 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  28.76 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  29.03 
 
 		 374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  28.49 
 
 		 369 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  29.83 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  29.6 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  24.8 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  26.74 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  28.42 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  28.76 
 
 		 369 aa  116  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  26.98 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  24.8 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  27.63 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  35.67 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  26.91 
 
 		 367 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  26.81 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  27.73 
 
 		 368 aa  110  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  25.41 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  38.51 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  34.1 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  29.46 
 
 		 371 aa  99.8  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  36.69 
 
 		 330 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  24.18 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  36.69 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  35.84 
 
 		 330 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  25.21 
 
 		 368 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  25.48 
 
 		 370 aa  93.2  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  36.09 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  28.66 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0805  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.89 
 
 		 364 aa  47.4  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5862  GTP-binding protein YchF  27.68 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1246  GTP-binding proten HflX  27.21 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  28.87 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  44.64 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  26.47 
 
 		 667 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1574  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  20.8 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  31.65 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1047  hypothetical protein  22.87 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl660  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.79 
 
 		 364 aa  43.9  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  25.29 
 
 		 669 aa  43.5  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  28.68 
 
 		 329 aa  43.5  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0395  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.55 
 
 		 363 aa  43.5  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186596  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  29.93 
 
 		 560 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>