More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1338 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  80 
 
 		 570 aa  968    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 588 aa  658    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  82.46 
 
 		 570 aa  941    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 570 aa  1161    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  77.54 
 
 		 570 aa  959    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 569 aa  555  1e-156  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 574 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 566 aa  488  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 555 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 555 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 555 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 555 aa  414  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 564 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 634 aa  382  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 561 aa  380  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 562 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 561 aa  373  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 569 aa  371  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 560 aa  365  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 573 aa  318  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 590 aa  313  7.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 582 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 574 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 569 aa  295  1e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 579 aa  273  5.000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 569 aa  211  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 587 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 555 aa  205  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 565 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 555 aa  204  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 781 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 557 aa  203  7e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 565 aa  203  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 568 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 570 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 555 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 553 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 579 aa  197  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.450969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 		 554 aa  196  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 555 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 559 aa  196  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 		 552 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 		 816 aa  195  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 552 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 556 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 563 aa  194  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 		 552 aa  194  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 548 aa  194  5e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 555 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 554 aa  193  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 554 aa  192  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  30.19 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 556 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 556 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 556 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 569 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 552 aa  192  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 556 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 569 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 		 556 aa  191  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 568 aa  191  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 569 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 596 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 569 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 569 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1300  glutaminyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 794 aa  191  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.91877 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 569 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 569 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 557 aa  190  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 569 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 555 aa  190  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 569 aa  190  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 556 aa  189  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 580 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 564 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0665  glutaminyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 579 aa  189  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0340381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 		 561 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 569 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 569 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 569 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>