39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1306 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1306  hydrogenase expression/synthesis, HypA  100 
 
 		 136 aa  275  1e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.551404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0412  hydrogenase expression/synthesis HypA  73.33 
 
 		 136 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65842  normal  0.014846 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0192  hydrogenase expression/synthesis, HypA  70.59 
 
 		 136 aa  214  4e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.342154 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1569  hypothetical protein  66.18 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0913  hydrogenase expression/synthesis, HypA  44.78 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.533701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0595  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.72 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0679  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.03 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0074  hydrogenase nickel incorporation protein  30.65 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1272  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.23 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00563885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  40.48 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  32.91 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  32.14 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  29.11 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.83 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.16 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.75 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.407443  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  29.63 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.73 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4607  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.71 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3821  hydrogenase expression/synthesis, HypA  26.36 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631833  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.5 
 
 		 117 aa  42  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.38 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  29.41 
 
 		 133 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.75 
 
 		 113 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.86 
 
 		 114 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0474  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.58 
 
 		 115 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.635429  normal  0.537416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1665  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.75 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.559753  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0757  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.75 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.497459  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0879  hypothetical protein  31.52 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696362  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.33 
 
 		 284 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0070  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.19 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4564  hypothetical protein  31.52 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0397975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2483  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.46 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2782  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.2 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.19 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0426  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.36 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0437  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.36 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.525876 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.18 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.17 
 
 		 115 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>