More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1576 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1576  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
419 aa  855    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725209 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0861  gamma-glutamyl phosphate reductase  76.26 
 
 
417 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0911248  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1865  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.52 
 
 
418 aa  634    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1100  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.63 
 
 
418 aa  617  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.95 
 
 
418 aa  596  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000378604  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1684  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.35 
 
 
418 aa  586  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000238537  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1479  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.22 
 
 
429 aa  577  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1574  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.56 
 
 
417 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1415  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.81 
 
 
417 aa  448  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4430  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 
416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0494311  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6814  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.61 
 
 
415 aa  401  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0152004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 
415 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.65 
 
 
416 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.75 
 
 
415 aa  342  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.77 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2009  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.28 
 
 
425 aa  339  4e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00109825  hitchhiker  0.000000000000564296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3197  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.19 
 
 
434 aa  340  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.97 
 
 
418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1018  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  44.31 
 
 
425 aa  336  5e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.15 
 
 
419 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.72 
 
 
418 aa  335  9e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.52 
 
 
424 aa  334  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.8 
 
 
420 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.28 
 
 
424 aa  333  4e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.74 
 
 
415 aa  332  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.74 
 
 
415 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.68 
 
 
418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.88 
 
 
430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2141  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.21 
 
 
459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.83 
 
 
419 aa  326  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.54 
 
 
415 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0784  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.71 
 
 
423 aa  325  6e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.62 
 
 
423 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.04 
 
 
413 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.3 
 
 
415 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.86 
 
 
411 aa  323  5e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.32 
 
 
418 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.2 
 
 
414 aa  323  5e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.44 
 
 
415 aa  322  6e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.3 
 
 
415 aa  322  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.3 
 
 
415 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.5 
 
 
424 aa  322  8e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.29 
 
 
413 aa  322  9.000000000000001e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.3 
 
 
415 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.34 
 
 
423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.95 
 
 
418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1645  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.77 
 
 
431 aa  319  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  hitchhiker  0.00108459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.32 
 
 
415 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0083  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.99 
 
 
425 aa  318  7.999999999999999e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.03 
 
 
418 aa  318  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.41 
 
 
417 aa  318  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.79 
 
 
418 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.83 
 
 
417 aa  317  4e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11440  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  45.09 
 
 
446 aa  315  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3543  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.63 
 
 
415 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3538  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.63 
 
 
415 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3611  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.63 
 
 
415 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0809422  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0634  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.66 
 
 
407 aa  315  9e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18230  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.76 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.65 
 
 
420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.65 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  41.65 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7264  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.93 
 
 
419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.05 
 
 
414 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2992  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.05 
 
 
414 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.440021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.89 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.09 
 
 
420 aa  313  4.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01163  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.71 
 
 
411 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  43 
 
 
415 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1268  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
409 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.18 
 
 
418 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.25 
 
 
424 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.46 
 
 
417 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2387  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.66 
 
 
450 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0346385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.12 
 
 
429 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.03 
 
 
416 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1818  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.81 
 
 
429 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  43.73 
 
 
429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.63 
 
 
421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.15 
 
 
445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.79 
 
 
416 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.13 
 
 
418 aa  309  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.79 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.79 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.98 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.32 
 
 
424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.65 
 
 
415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2252  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.19 
 
 
415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.628785  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3934  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.91 
 
 
415 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2884  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.48 
 
 
428 aa  306  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.83 
 
 
415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.842217  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.06 
 
 
424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.68 
 
 
425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.58 
 
 
422 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004267  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.22 
 
 
411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000573407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2993  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.53 
 
 
415 aa  306  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.08 
 
 
417 aa  306  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.59 
 
 
418 aa  305  8.000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.89 
 
 
417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.23 
 
 
416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>