125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03486 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 109 aa  214  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  65.22 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  49.45 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  49.45 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  38.89 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  46.77 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  42.68 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  47.95 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  38.89 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  37.66 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  40.58 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  40.3 
 
 		 118 aa  57  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  41.46 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  41.46 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  40.3 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  37.68 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  39.13 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  37.68 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  34.21 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  34.21 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  34.21 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  34.21 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  38.67 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  34.21 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  37.68 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  37.66 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  38.81 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  37.68 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  38.81 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  41.67 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  37.33 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  37.68 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  38.96 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  44.78 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  40.85 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  45.71 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  48.57 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  35.82 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2826  ribonuclease P protein component  51.16 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  46.3 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  39.44 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  38.81 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  40.3 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  33.75 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  44.16 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102633  hitchhiker  0.0000000753131 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  36.62 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  40.3 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  40.3 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  40.3 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  37.68 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  40.3 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  40.3 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  40.3 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  38.81 
 
 		 108 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  40.3 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  40.3 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  40.3 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  40.3 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  40.3 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  40.3 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  40.3 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  35.82 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  36 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  36 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  36 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  48.21 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  48.21 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  34.67 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  37.97 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  34.67 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  41.79 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  48.21 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  35.62 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  35.62 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  35.62 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  35.62 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  40.85 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  33.33 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  48.33 
 
 		 227 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2413  ribonuclease P protein component  32.86 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0343106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  42.11 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  34.33 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  39.74 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  57.14 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  46.43 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0134  ribonuclease P protein component  34.25 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0423414  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  42.11 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  30.56 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  31.43 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  36.71 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  57.14 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  39.73 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  37.14 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  35.9 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  46.43 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  34.33 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  37.14 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  31.08 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2778  ribonuclease P protein component  38.57 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.07678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>