159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03317 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03317  ISxac1 transposase  100 
 
 
136 aa  268  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04657  ISXoo8 transposase  92.31 
 
 
407 aa  243  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.18331  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02581  ISXoo8 transposase  92.31 
 
 
404 aa  242  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01507  ISXoo8 transposase  91.54 
 
 
407 aa  240  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01863  ISXoo8 transposase  91.54 
 
 
407 aa  240  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.855471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02154  ISXoo8 transposase  91.54 
 
 
407 aa  240  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775985  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01801  ISXoo8 transposase  92.31 
 
 
407 aa  240  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03192  ISXoo8 transposase  91.54 
 
 
407 aa  240  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04334  ISXoo8 transposase  91.54 
 
 
407 aa  240  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000241715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05638  ISXoo8 transposase  91.54 
 
 
407 aa  240  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00634  ISXoo8 transposase  90.77 
 
 
407 aa  237  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04852  ISxac1 transposase  94.74 
 
 
61 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00697578  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02577  hypothetical protein  35.54 
 
 
312 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02579  hypothetical protein  35.54 
 
 
399 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01925  hypothetical protein  35.54 
 
 
399 aa  77  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02811  hypothetical protein  35.54 
 
 
399 aa  77  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08194  transposase  35.54 
 
 
399 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.679296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01470  hypothetical protein  35.54 
 
 
399 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01664  hypothetical protein  35.54 
 
 
399 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01477  hypothetical protein  34.71 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06074  hypothetical protein  34.71 
 
 
399 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02007  hypothetical protein  34.71 
 
 
399 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02009  hypothetical protein  34.71 
 
 
405 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02494  hypothetical protein  34.71 
 
 
399 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05982  hypothetical protein  34.71 
 
 
399 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05054  hypothetical protein  34.71 
 
 
399 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1845  transposase, IS4 family protein  36.09 
 
 
397 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0185654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1902  transposase, IS4 family protein  36.09 
 
 
397 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0975496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3147  transposase, IS4 family protein  36.09 
 
 
397 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2541  IS10, transposase  35.04 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.2795e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0820  transposase  35.04 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00771423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0337  IS10 transposase  35.04 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1603  IS10 transposase  35.04 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4777  IS10 transposase  35.04 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.271469  normal  0.676926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3181  IS10 transposase  35.04 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4716  transposase (IS4 family)  35.04 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189582  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1590  IS10 transposase  35.04 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3046  IS10 transposase  35.04 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2715  IS10 transposase  35.04 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0524  IS10 transposase  35.04 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4558  IS10 transposase  35.04 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45960  Transposase, IS4  41.32 
 
 
397 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3303  transposase IS4 family protein  33.88 
 
 
397 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1976  transposase IS4 family protein  33.88 
 
 
397 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00982369  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3793  transposase IS4 family protein  33.88 
 
 
397 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2015  transposase IS4 family protein  33.88 
 
 
397 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1244  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4275.4  transposase  35.25 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1945  transposase, IS4  35.25 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0146  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0731  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1541  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1974  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2226  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2283  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3567  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3625  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4000  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4239  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4432  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4437  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0102  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0136  ISSod3, transposase  35.25 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1949  putative transposase  34.43 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2465  IS4 family transposase  36.07 
 
 
404 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000609587  hitchhiker  0.0000155014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3499  ISSod3, transposase  34.43 
 
 
404 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1943  transposase, IS4  34.43 
 
 
420 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1636  transposase, IS4 family protein  34.43 
 
 
460 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1846  transposase, IS4  34.71 
 
 
402 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.79186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2740  transposase, IS4  34.71 
 
 
402 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2240  IS4 family transposase  32.23 
 
 
400 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0969816  normal  0.0243292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0461  transposase, IS4 family protein  32.23 
 
 
400 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1919  transposase IS4 family protein  32.23 
 
 
400 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.035581  normal  0.0427868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1916  transposase IS4 family protein  32.23 
 
 
400 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.511256  normal  0.075627 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1473  transposase, IS4  31.4 
 
 
400 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2062  transposase, IS4  31.4 
 
 
400 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2254  transposase, IS4  31.4 
 
 
400 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2960  transposase, IS4  31.4 
 
 
400 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0212641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3325  transposase, IS4  31.4 
 
 
400 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0863  transposase, IS4  33.88 
 
 
402 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.174344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1387  transposase, IS4  33.88 
 
 
402 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1849  putative transposase  34.96 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2598  transposase, IS4  33.88 
 
 
402 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2744  transposase, IS4  33.88 
 
 
402 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3451  transposase, IS4  33.88 
 
 
402 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25520  Transposase, IS4  41.32 
 
 
400 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06245  hypothetical protein  35.24 
 
 
238 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01224  hypothetical protein  36.27 
 
 
181 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02010  hypothetical protein  36.27 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05431  hypothetical protein  34.4 
 
 
397 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03585  hypothetical protein  34.4 
 
 
184 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00840  hypothetical protein  36.27 
 
 
397 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01147  hypothetical protein  36.27 
 
 
397 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01480  hypothetical protein  36.27 
 
 
397 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01644  hypothetical protein  36.27 
 
 
397 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01678  hypothetical protein  36.27 
 
 
397 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01679  hypothetical protein  36.27 
 
 
397 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01845  hypothetical protein  36.27 
 
 
397 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02020  hypothetical protein  36.27 
 
 
397 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05564  hypothetical protein  36.27 
 
 
397 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>