80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02780 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  96.44 
 
 
846 bp  1291    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02391  ISXoo3 transposase ORF B  96.84 
 
 
846 bp  1314    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.555401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02481    96.87 
 
 
546 bp  942    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02530  ISXoo3 transposase ORF B  93.18 
 
 
486 bp  690    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02557    93.55 
 
 
546 bp  799    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.141347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02564  transposase  98.16 
 
 
546 bp  997    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  95.13 
 
 
846 bp  1211    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02741    96.33 
 
 
783 bp  1235    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02780    100 
 
 
759 bp  1505    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02902    97.43 
 
 
786 bp  1237    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  92.99 
 
 
846 bp  1078    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03027    98.56 
 
 
486 bp  908    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03281    98.16 
 
 
546 bp  997    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357178  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06246  ISXoo3 transposase ORF B  94.33 
 
 
846 bp  1164    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03666    98.02 
 
 
816 bp  1386    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03720  transposase  97.42 
 
 
546 bp  965    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03796    97.42 
 
 
546 bp  965    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  96.05 
 
 
846 bp  1267    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  94.2 
 
 
846 bp  1156    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04015    94.59 
 
 
783 bp  1063    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04078    97.94 
 
 
486 bp  884    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.532563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  96.05 
 
 
846 bp  1267    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  94.99 
 
 
846 bp  1203    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  98.02 
 
 
846 bp  1386    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04488  transposase  98.13 
 
 
426 bp  775    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02161  transposase  97.42 
 
 
546 bp  965    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01072  ISXoo3 transposase ORF B  94.33 
 
 
846 bp  1164    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01161  transposase  98.83 
 
 
648 bp  967    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00281  transposase  97.24 
 
 
546 bp  957    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01970    93.8 
 
 
483 bp  698    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00429349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01537    96.44 
 
 
807 bp  1291    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.502784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01542    96.85 
 
 
531 bp  763    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01848    97.29 
 
 
786 bp  1229    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  92.99 
 
 
846 bp  1078    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01934  ISXoo3 transposase ORF A  96.63 
 
 
774 bp  755    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01541  transposase  97.97 
 
 
345 bp  628  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.728343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01935    97.97 
 
 
345 bp  628  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00732  transposase  96.17 
 
 
525 bp  569  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01958  transposase  89.3 
 
 
726 bp  519  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.064583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04077  transposase  95.54 
 
 
498 bp  438  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04489    95.17 
 
 
357 bp  430  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00700  transposase  100 
 
 
300 bp  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.782248  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03026  transposase  92.94 
 
 
357 bp  383  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02162    98.51 
 
 
222 bp  377  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796965  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03721    98.51 
 
 
222 bp  377  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02529  transposase  98.51 
 
 
300 bp  377  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02556  transposase  98.51 
 
 
300 bp  377  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01971  transposase  98.02 
 
 
294 bp  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0526075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03280  transposase  98.02 
 
 
309 bp  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.495134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03797  transposase  97.52 
 
 
450 bp  361  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00282    97.03 
 
 
309 bp  353  5e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02482  transposase  95.54 
 
 
300 bp  329  7e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01377  transposase  88.52 
 
 
318 bp  319  7e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03626  transposase  94.55 
 
 
261 bp  313  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00239  transposase  86.12 
 
 
528 bp  311  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01967  hypothetical protein  96.89 
 
 
177 bp  280  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00113705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02571  transposase  91.75 
 
 
414 bp  274  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04084  transposase  95.09 
 
 
189 bp  260  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01378  transposase  89.11 
 
 
195 bp  113  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00856  hypothetical protein  83.44 
 
 
153 bp  101  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00434915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06071  hypothetical protein  83.44 
 
 
153 bp  101  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000238021  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05448  IS66 family element, Orf1 protein, putative  100 
 
 
399 bp  99.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05705  IS66 family element, Orf1 protein, putative  100 
 
 
399 bp  99.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05777  IS66 family element, Orf1 protein, putative  100 
 
 
393 bp  99.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  94.59 
 
 
792 bp  58  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1279  putative transposase  84.21 
 
 
264 bp  56  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0690484  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1302  putative transposase  81.08 
 
 
522 bp  54  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  87.76 
 
 
930 bp  50.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    93.94 
 
 
2455 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3070    100 
 
 
691 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>