297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02481 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  94.87 
 
 
846 bp  860    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02557    92.67 
 
 
546 bp  765    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.141347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  96.52 
 
 
846 bp  932    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02741    97.32 
 
 
783 bp  916    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04078    96.91 
 
 
486 bp  844    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.532563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04015    94.18 
 
 
783 bp  706    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01970    93.53 
 
 
483 bp  682    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00429349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01161  transposase  97.27 
 
 
648 bp  904    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02564  transposase  97.25 
 
 
546 bp  963    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  96.52 
 
 
846 bp  932    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03027    97.12 
 
 
486 bp  852    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02530  ISXoo3 transposase ORF B  93.02 
 
 
486 bp  688    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  94.69 
 
 
846 bp  852    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04488  transposase  97.19 
 
 
426 bp  743    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  95.42 
 
 
846 bp  884    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01537    97.44 
 
 
807 bp  971    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.502784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01072  ISXoo3 transposase ORF B  93.92 
 
 
846 bp  815    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02161  transposase  96.52 
 
 
546 bp  932    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01848    97.54 
 
 
786 bp  862    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02780    96.87 
 
 
759 bp  942    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  94.69 
 
 
846 bp  852    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02481    100 
 
 
546 bp  1082    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  94.69 
 
 
846 bp  852    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03281    97.62 
 
 
546 bp  979    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357178  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02902    96.51 
 
 
786 bp  823    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02391  ISXoo3 transposase ORF B  97.44 
 
 
846 bp  971    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.555401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03796    96.52 
 
 
546 bp  932    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  97.07 
 
 
846 bp  955    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  94.69 
 
 
846 bp  852    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03720  transposase  96.89 
 
 
546 bp  948    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06246  ISXoo3 transposase ORF B  93.92 
 
 
846 bp  815    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03666    96.52 
 
 
816 bp  932    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00281  transposase  96.34 
 
 
546 bp  924    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01935    95.36 
 
 
345 bp  557  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01541  transposase  95.36 
 
 
345 bp  557  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.728343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01542    99.57 
 
 
531 bp  444  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01934  ISXoo3 transposase ORF A  99.14 
 
 
774 bp  436  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03626  transposase  97.01 
 
 
261 bp  351  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01377  transposase  88.52 
 
 
318 bp  319  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04084  transposase  95.71 
 
 
189 bp  268  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01958  transposase  88.57 
 
 
726 bp  264  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.064583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01967  hypothetical protein  91.93 
 
 
177 bp  216  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00113705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00732  transposase  97.98 
 
 
525 bp  180  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03026  transposase  96.43 
 
 
357 bp  95.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04077  transposase  96.43 
 
 
498 bp  95.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04489    96.43 
 
 
357 bp  95.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00239  transposase  86 
 
 
528 bp  87.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00856  hypothetical protein  81.46 
 
 
153 bp  77.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00434915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06071  hypothetical protein  81.46 
 
 
153 bp  77.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000238021  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  94.59 
 
 
792 bp  58  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3070    86.44 
 
 
691 bp  54  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1119    84.85 
 
 
741 bp  52  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    93.94 
 
 
2455 bp  50.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  93.94 
 
 
1118 bp  50.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0563  A, transposase OrfB  85.71 
 
 
2394 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0578  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00042542  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0008  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0023  IS1404 transposase  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0026  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0068  IS1404 transposase  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0117  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0159  IS1404 transposase  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0183  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0263  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0587266  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0283  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0301  IS1404 transposase  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0406  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0471  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0565  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0644  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.491667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0736  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0817  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0374  IS1404 transposase  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0671  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00222254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0865  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0887  IS407A, transposase OrfB  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0070825  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0925  IS1404 transposase  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0960  IS1404 transposase  85.71 
 
 
834 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>