28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02098 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02098  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  750    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1101  hypothetical protein  38.74 
 
 
309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0059  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110579  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1682  hypothetical protein  35.63 
 
 
305 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.450349 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1323  hypothetical protein  32.56 
 
 
253 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1740  hypothetical protein  28.22 
 
 
282 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3650  hypothetical protein  26.59 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02030  hypothetical protein  25.84 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00038  hypothetical protein  27.07 
 
 
249 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.960532  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  26.19 
 
 
263 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0224  hypothetical protein  26.86 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1251  hypothetical protein  26.86 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2582  hypothetical protein  26.86 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1419  hypothetical protein  27.08 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1340  hypothetical protein  26.86 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1422  hypothetical protein  26.86 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.727382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0496  hypothetical protein  26.86 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172115  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3994  hypothetical protein  27.82 
 
 
247 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.900475  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4458  hypothetical protein  25.62 
 
 
247 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1280  hypothetical protein  26.03 
 
 
247 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106415  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0352  hypothetical protein  27.41 
 
 
248 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0940  hypothetical protein  26.92 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3588  hypothetical protein  25.81 
 
 
259 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0475559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4078  hypothetical protein  26.91 
 
 
246 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682161  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0487  hypothetical protein  28.26 
 
 
263 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38522  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0325  hypothetical protein  27.34 
 
 
259 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.391296  normal  0.511611 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0478  hypothetical protein  26.49 
 
 
224 aa  43.9  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00358452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0790  hypothetical protein  22.73 
 
 
269 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000900967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>