44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5448 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_5001  hypothetical protein  90.72 
 
 		 815 aa  1506    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5448  hypothetical protein  100 
 
 		 808 aa  1630    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5570  hypothetical protein  82.67 
 
 		 816 aa  1387    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7560  hypothetical protein  77.92 
 
 		 811 aa  1236    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125475  normal  0.437403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  27.27 
 
 		 956 aa  72.4  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.91 
 
 		 959 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.5 
 
 		 975 aa  64.3  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  30.49 
 
 		 788 aa  62  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  26.2 
 
 		 1240 aa  60.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.9 
 
 		 971 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  26.41 
 
 		 963 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.19 
 
 		 971 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  23.25 
 
 		 1097 aa  54.7  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 291 aa  54.3  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  28.74 
 
 		 359 aa  53.9  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  29.13 
 
 		 785 aa  53.9  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.97 
 
 		 811 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  25.82 
 
 		 275 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  25.45 
 
 		 757 aa  51.6  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.75 
 
 		 891 aa  51.6  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  26.55 
 
 		 788 aa  51.2  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  28.04 
 
 		 761 aa  50.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 		 290 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  30 
 
 		 760 aa  50.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  27.65 
 
 		 765 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  24.21 
 
 		 758 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 287 aa  50.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  28.25 
 
 		 799 aa  49.3  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  26.11 
 
 		 837 aa  48.5  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  24.24 
 
 		 315 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  24.24 
 
 		 315 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  33.33 
 
 		 797 aa  48.1  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.21 
 
 		 835 aa  47.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  27.67 
 
 		 780 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 287 aa  47.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 		 301 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  23.72 
 
 		 334 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  28.02 
 
 		 826 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  23.48 
 
 		 456 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 299 aa  45.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  26.27 
 
 		 462 aa  45.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  28.16 
 
 		 791 aa  44.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 333 aa  44.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.62 
 
 		 867 aa  44.3  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>