23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3865 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3865  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  831    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1620  hypothetical protein  88.69 
 
 		 398 aa  748    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3455  aminotransferase class I and II  29.74 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36612  hitchhiker  0.000000549175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2431  hypothetical protein  28.95 
 
 		 305 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000928736  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2134  aminotransferase, class I  21.95 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  26.75 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2582  aminotransferase, class I and II  22.46 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2636  aminotransferase class I and II  22.46 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  23.11 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3001  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 383 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  20.98 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  22.29 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  21.45 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1614  cystathionine beta-lyase  22.56 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  22.77 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  22.61 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  23.63 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4096  GntR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 474 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  22.71 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.74 
 
 		 357 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  20.8 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  21.86 
 
 		 394 aa  42.7  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>