59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2281 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2281  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  100 
 
 
237 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2079  phosphoserine phosphatase  95.12 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22014  hitchhiker  0.00429675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1758  phosphoserine phosphatase  91.22 
 
 
205 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733968  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2544  phosphoserine phosphatase  89.76 
 
 
205 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.938573  hitchhiker  0.0000142825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3550  phosphoserine phosphatase  86.83 
 
 
205 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41830  phosphoserine phosphatase  86.83 
 
 
205 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1670  phosphoserine phosphatase  76.1 
 
 
205 aa  334  7e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.685249  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1581  phosphoserine phosphatase  76.38 
 
 
204 aa  326  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.051516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1629  phosphoserine phosphatase  62.19 
 
 
204 aa  259  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0057  phosphoserine phosphatase  62.12 
 
 
203 aa  254  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0290  phosphoserine phosphatase  61.14 
 
 
201 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2053  phosphoserine phosphatase  61.69 
 
 
204 aa  248  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0583  phosphoserine phosphatase  60.2 
 
 
202 aa  248  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3725  phosphoserine phosphatase  62.37 
 
 
191 aa  243  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0818  phosphoserine phosphatase  57.21 
 
 
201 aa  241  7e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1390  phosphoserine phosphatase  56.22 
 
 
202 aa  241  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3902  phosphoserine phosphatase  55.5 
 
 
205 aa  228  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3211  phosphoserine phosphatase  57.67 
 
 
204 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24420  phosphoserine phosphatase  48.68 
 
 
203 aa  193  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1446  phosphoserine phosphatase  49.21 
 
 
200 aa  185  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343477  normal  0.353206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1112  phosphoserine phosphatase  35.57 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1255  hypothetical protein  38.73 
 
 
177 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  28.37 
 
 
298 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  25.14 
 
 
400 aa  52  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  28.67 
 
 
298 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  26.56 
 
 
405 aa  48.9  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0308  phosphoserine phosphatase SerB  27.14 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  24.59 
 
 
400 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 
411 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  26.88 
 
 
410 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  28.88 
 
 
404 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1689  phosphoserine phosphatase SerB  26.98 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  27.23 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0333  phosphoserine phosphatase SerB  25.75 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  25.54 
 
 
413 aa  46.2  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  26.78 
 
 
429 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  25.53 
 
 
332 aa  45.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2319  phosphoserine phosphatase SerB  29.91 
 
 
213 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0330  phosphoserine phosphatase SerB  26.8 
 
 
207 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.414874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  28.02 
 
 
429 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0148  HAD family hydrolase  27.22 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  26.6 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  26.6 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1689  phosphoserine phosphatase SerB  26.36 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  28.37 
 
 
410 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  28.57 
 
 
404 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  28.02 
 
 
404 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  28.47 
 
 
410 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  25 
 
 
297 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  24.26 
 
 
330 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  23.68 
 
 
400 aa  43.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  24.26 
 
 
330 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15880  phosphoserine phosphatase SerB  29.48 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0152632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  25.68 
 
 
210 aa  43.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  27.4 
 
 
298 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  24.26 
 
 
330 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  21.98 
 
 
435 aa  42  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  31.06 
 
 
409 aa  42  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0196  HAD family hydrolase  27.22 
 
 
202 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>