28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4861 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4861  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  312  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55790  hypothetical protein  86.36 
 
 
168 aa  249  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  41.1 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  41.26 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  40.69 
 
 
146 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4834  hypothetical protein  39.87 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.655399  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  33.55 
 
 
160 aa  84.3  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  37.41 
 
 
174 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  31.51 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  29.11 
 
 
165 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  30.38 
 
 
171 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  27.61 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  27.61 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  34.67 
 
 
167 aa  47.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  35.06 
 
 
156 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  30.43 
 
 
153 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  47.92 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  47.92 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  47.92 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  47.92 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  47.92 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  47.92 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  47.92 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  41.67 
 
 
168 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  30.68 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  40.74 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  40.74 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  40.74 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>