51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4529 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  55.76 
 
 		 642 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  100 
 
 		 643 aa  1314    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  55.16 
 
 		 634 aa  688    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  93.43 
 
 		 639 aa  1193    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  64.32 
 
 		 631 aa  764    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  93.58 
 
 		 639 aa  1194    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  52.61 
 
 		 621 aa  609  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  51.53 
 
 		 627 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  51.87 
 
 		 614 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  50.87 
 
 		 615 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  51.45 
 
 		 616 aa  601  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  50.16 
 
 		 615 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  49.61 
 
 		 593 aa  598  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  51.95 
 
 		 612 aa  600  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  48.82 
 
 		 599 aa  593  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  50.9 
 
 		 617 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  50 
 
 		 680 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  49.69 
 
 		 615 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  51.55 
 
 		 660 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  47.09 
 
 		 575 aa  538  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  49.25 
 
 		 623 aa  533  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  47.13 
 
 		 569 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  47.99 
 
 		 595 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  38.34 
 
 		 640 aa  441  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  68.33 
 
 		 318 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  29.95 
 
 		 624 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51640  hypothetical protein  92 
 
 		 125 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000358498  hitchhiker  0.000035713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  49.21 
 
 		 282 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  34.68 
 
 		 560 aa  130  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  33.33 
 
 		 569 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 		 861 aa  126  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  35.38 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3687  putative helicase  31.43 
 
 		 398 aa  123  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  30.04 
 
 		 485 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  31.55 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25110  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4411  hypothetical protein  27.53 
 
 		 308 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0065  type IV conjugative transfer system protein TraI  25.7 
 
 		 990 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  27.27 
 
 		 1096 aa  92  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3051  protein of unknown function DUF1528  29.28 
 
 		 478 aa  91.7  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  22.02 
 
 		 721 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4265  relaxase  26.83 
 
 		 941 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350547  normal  0.8702 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2994  hypothetical protein  23.83 
 
 		 445 aa  73.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2854  hypothetical protein  22.98 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  21.56 
 
 		 611 aa  67.4  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  23.6 
 
 		 597 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  20.87 
 
 		 549 aa  60.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2306  relaxase  20.97 
 
 		 571 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4267  relaxase  19.2 
 
 		 642 aa  51.2  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  40.3 
 
 		 309 aa  44.3  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 		 320 aa  43.9  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>