More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3443 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  58.21 
 
 		 569 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  60.37 
 
 		 541 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  84.02 
 
 		 459 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  100 
 
 		 539 aa  1105    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  60.48 
 
 		 539 aa  689    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  84.3 
 
 		 541 aa  932    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  58.21 
 
 		 542 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  82.09 
 
 		 541 aa  922    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  82.89 
 
 		 534 aa  916    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  57.84 
 
 		 542 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  62.99 
 
 		 541 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  85.61 
 
 		 541 aa  914    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  57.57 
 
 		 541 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  60.3 
 
 		 539 aa  690    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  83.93 
 
 		 541 aa  929    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  93.88 
 
 		 539 aa  1040    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  58.63 
 
 		 541 aa  674    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  62.99 
 
 		 541 aa  713    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  99.26 
 
 		 539 aa  1096    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  57.94 
 
 		 541 aa  668    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  59.37 
 
 		 546 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  96.85 
 
 		 539 aa  1072    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  57.88 
 
 		 545 aa  674    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  58.21 
 
 		 542 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  57.84 
 
 		 542 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  85.98 
 
 		 541 aa  919    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  57.84 
 
 		 542 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  62.29 
 
 		 540 aa  683    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  55.41 
 
 		 540 aa  633  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  55.64 
 
 		 536 aa  631  1e-180  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  57.2 
 
 		 540 aa  630  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  55.22 
 
 		 542 aa  621  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  55.81 
 
 		 526 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  55.68 
 
 		 560 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  54.75 
 
 		 524 aa  604  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  43.65 
 
 		 588 aa  416  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.1 
 
 		 477 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.56 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.33 
 
 		 479 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.33 
 
 		 479 aa  236  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.33 
 
 		 479 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.33 
 
 		 479 aa  236  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.33 
 
 		 479 aa  236  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.1 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.33 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.33 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  31.4 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  33.56 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  32.69 
 
 		 466 aa  232  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  31.95 
 
 		 479 aa  230  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.95 
 
 		 482 aa  220  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.73 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  30.25 
 
 		 471 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  31 
 
 		 475 aa  217  4e-55  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  30.48 
 
 		 482 aa  216  9e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  31.22 
 
 		 476 aa  211  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.22 
 
 		 472 aa  201  3e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  31.42 
 
 		 482 aa  197  5.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  30.06 
 
 		 477 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  28.04 
 
 		 499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  33.18 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  30.18 
 
 		 499 aa  167  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  29.27 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  30.77 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  27.11 
 
 		 498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000636  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  30.2 
 
 		 506 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2361  aldehyde dehydrogenase  30.69 
 
 		 683 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.202698 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  28.78 
 
 		 505 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0060  succinate semialdehyde dehydrogenase  28.83 
 
 		 507 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.455704  hitchhiker  0.00355427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  32.01 
 
 		 485 aa  163  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.44 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  31.93 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  29.44 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  28.54 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  28.3 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  28.54 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  28.3 
 
 		 479 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  28.3 
 
 		 479 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  28.3 
 
 		 479 aa  161  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  27.03 
 
 		 489 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  28.06 
 
 		 479 aa  159  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  29.39 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  28.06 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3822  Aldehyde Dehydrogenase  27.18 
 
 		 518 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.959646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  27.7 
 
 		 502 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  29.31 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  28.84 
 
 		 482 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  30 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  28.84 
 
 		 482 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  32.4 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  28.84 
 
 		 482 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2217  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  26.74 
 
 		 488 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  29.18 
 
 		 482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  27.63 
 
 		 484 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  27.46 
 
 		 475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  28.06 
 
 		 479 aa  157  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  27.86 
 
 		 497 aa  157  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  27.25 
 
 		 478 aa  156  7e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0759  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  28.85 
 
 		 484 aa  156  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0247006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  28.64 
 
 		 489 aa  156  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>