17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0575 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 156 aa  309  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  309  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  94.23 
 
 		 156 aa  296  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4589  peptidase A24A prepilin type IV  86.54 
 
 		 156 aa  246  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  61.54 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0639  peptidase A24A, prepilin type IV  50 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4375  peptidase A24A, prepilin type IV  47.68 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4835  hypothetical protein  48.08 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  36.64 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  32.62 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4862  hypothetical protein  36.44 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0540679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2165  peptidase A24A, prepilin type IV  30.95 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065681 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  32.97 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  32.97 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  34.07 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  32.97 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  32.65 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>