34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0308 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0308  phycoerythrin linker protein CpeS-like  100 
 
 		 183 aa  359  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.244781  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03301  phycoerythrin linker protein CpeS  89.62 
 
 		 183 aa  306  8e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.21635  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03311  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  89.07 
 
 		 182 aa  301  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.449065  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03401  phycoerythrin linker protein CpeS  66.12 
 
 		 183 aa  245  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.000238694  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  39.43 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22301  phycoerythrin linker protein CpeS  40.24 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  36.42 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  38.73 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  32.57 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  31.4 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  35.8 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03381  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  35.67 
 
 		 178 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  30.46 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03911  phycoerythrin linker protein CpeS  37.74 
 
 		 161 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142306  normal  0.0710975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  31.17 
 
 		 196 aa  94.4  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  28.98 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  30.99 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  29.82 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  28.75 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  28.75 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  30.18 
 
 		 197 aa  87.8  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  27.78 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  30.05 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  31.25 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  27.62 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  27.91 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0424  hypothetical protein  27.68 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  27.68 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  25.86 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  25.86 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  24.86 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1048  hypothetical protein  23.57 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.48035  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1167  hypothetical protein  22.29 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.683813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>