81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65994 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_65994  translational repressor of GCN4  100 
 
 		 362 aa  760    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01430  hypothetical protein  38.65 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00362706  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08799  tRNA methyltransferase subunit GCD14, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09620)  32.85 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675842 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35232  predicted protein  33.33 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112484  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3687  predicted protein  36.51 
 
 		 239 aa  164  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0625278  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0225  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.32 
 
 		 263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000107997  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1129  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  28.69 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1401  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  28.4 
 
 		 256 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2231  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  26.2 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000396256 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0690  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.32 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1601  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  32.26 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0179  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28.2 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1692  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  25.88 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0181  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28.2 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2378  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  27.64 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0927  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  27.09 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.769745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0323  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  25.4 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0069  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  27.2 
 
 		 253 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3348  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.91 
 
 		 279 aa  95.9  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0429  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferase-like protein  31.79 
 
 		 254 aa  95.9  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0656732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1587  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  27.13 
 
 		 263 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16240  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.98 
 
 		 255 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1919  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.7 
 
 		 302 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.134811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0539  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  23.81 
 
 		 306 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000466201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2288  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.4 
 
 		 254 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00198385  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0923  beta-aspartate methyltransferase  25 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1839  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  26.85 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.865717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22120  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  26.03 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1857  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  25.3 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0467  methyltransferase type 11  23.79 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2457  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  28.44 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5892  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  28.07 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0406172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  25.51 
 
 		 275 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1200  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.67 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0440767  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3065  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  26.03 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0788326 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1367  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  24.9 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3462  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  26.03 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0823  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  26.36 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0358944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2152  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  25.69 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2355  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.95 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.805289  normal  0.143216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20910  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  26.67 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0459  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  25.6 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2376  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  25.9 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2638  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  24.8 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427664  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0209  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  21.6 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0905  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.83 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56455  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12150  RNA methyltransferase  24.77 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1810  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  25.91 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0203  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  26.03 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0201025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2416  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  25.31 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3198  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  25.83 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2238  hypothetical protein  25.81 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3148  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  25.83 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215916  normal  0.672211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3136  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  25.83 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2677  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  25.1 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1298  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  25.57 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.84093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4474  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  27.39 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.135344 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0620  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  25.57 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16210  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  25.15 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0743414  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0685  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  25.37 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.727075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0645  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  28.63 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4884  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  25.2 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340373  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1182  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  25.31 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0707578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11850  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  24.14 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00898867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2514  SAM-dependent methyltransferase  25.1 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1485  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  23.45 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130209  normal  0.405795 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0804  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  26.75 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.10576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13950  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  25.54 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.846433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1915  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  24.9 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000210354 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0607  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  25.79 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0354  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  25.1 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000362524  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2632  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  25 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1224  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  27.75 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2172  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  24.48 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00868355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2005  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  25.4 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2243  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  23.01 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.834026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2306  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  23.85 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00564306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1481  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  26.67 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000220785  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1484  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  23.34 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0936  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  24.26 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0540  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase  24.74 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>