More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_51039 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_51039  Aspartate aminotransferase/Glutamic oxaloacetic transaminase AAT2/GOT1  100 
 
 		 403 aa  842    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06048  aspartate transaminase (Eurofung)  40.55 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.175084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66059  aspartate aminotransferase  37.35 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.789212 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00950  Aspartate aminotransferase, mitochondrial precursor, putative  37.85 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08709  aspartate transaminase, cytoplasmic (Eurofung)  39.16 
 
 		 416 aa  302  7.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00360  aspartate transaminase, putative  35.56 
 
 		 413 aa  280  3e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0699842  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01993  aspartate transaminase, mitochondrial (Eurofung)  35.34 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.303718 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80440  aspartate aminotransferase  34.79 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31597  predicted protein  34.09 
 
 		 399 aa  270  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.955549  normal  0.45996 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23871  aspartate aminotransferase  33.59 
 
 		 426 aa  269  7e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2280  aromatic amino acid aminotransferase  36.25 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2076  aromatic amino acid aminotransferase  35.56 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5339  aromatic-amino-acid aminotransferase  35.94 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  35.61 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  35.61 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  35.61 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  35.61 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  35.61 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  35.61 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  35.61 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  35.61 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1670  aromatic amino acid aminotransferase  34.45 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0668347  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  35.61 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  35.61 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  35.61 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  35.61 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  35.61 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  33.67 
 
 		 398 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  35.35 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  35.61 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  34.17 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2971  aromatic amino acid aminotransferase  36.73 
 
 		 405 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4898  aromatic amino acid aminotransferase  35.42 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1321  aromatic amino acid aminotransferase  36.48 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3097  aromatic amino acid aminotransferase  36.73 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6004  aromatic amino acid aminotransferase  33.93 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.443783  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  36.34 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3974  aromatic amino acid aminotransferase  36.34 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03886  hypothetical protein  36.34 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0274153  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  33.67 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  36.81 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2182  aromatic amino acid aminotransferase  36.81 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  36.08 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3939  Aromatic-amino-acid transaminase  36.34 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4541  aromatic amino acid aminotransferase  36.08 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4515  aromatic amino acid aminotransferase  36.08 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4268  aromatic amino acid aminotransferase  34.19 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0463663  normal  0.625536 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1403  aromatic amino acid aminotransferase  34.54 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000415206  normal  0.0752089 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4017  aromatic amino acid aminotransferase  33.68 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4350  aromatic amino acid aminotransferase  33.68 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461114  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1976  aromatic amino acid aminotransferase  32.07 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0721225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3759  aromatic amino acid aminotransferase  33.68 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5556  aromatic amino acid aminotransferase  36.08 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1557  aromatic amino acid aminotransferase  34.96 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4606  aromatic amino acid aminotransferase  36.08 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  33.67 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4233  aromatic amino acid aminotransferase  33.68 
 
 		 400 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4927  aromatic amino acid aminotransferase  34.7 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177363  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2326  aromatic amino acid aminotransferase  36.03 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.88203  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0667  aromatic amino acid aminotransferase  33.85 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.588804  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1111  aromatic amino acid aminotransferase  33.85 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2395  aromatic amino acid aminotransferase  33.85 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.441327  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1762  aromatic amino acid aminotransferase  33.85 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0798  aromatic amino acid aminotransferase  33.85 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  35.43 
 
 		 398 aa  249  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1187  aromatic amino acid aminotransferase  33.85 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  33.67 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1593  aromatic amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0225  aromatic amino acid aminotransferase  35.22 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4016  aromatic amino acid aminotransferase  32.83 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2805  aromatic amino acid aminotransferase  36.81 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  33.58 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  33.42 
 
 		 398 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3088  aromatic amino acid aminotransferase  32.16 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 396 aa  246  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2282  aromatic amino acid aminotransferase  32.75 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00982578  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  33.59 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  33.92 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  32.83 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3504  aromatic amino acid aminotransferase  34.48 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1976  aromatic amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0279387  normal  0.804208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  32.83 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2560  aromatic amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000517501  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  33.07 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  32.91 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2650  aromatic amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 396 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000706287  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  32.32 
 
 		 397 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3642  aromatic amino acid aminotransferase  34.48 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.463621  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  32.66 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0258  aromatic amino acid aminotransferase  35.04 
 
 		 397 aa  242  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  31.66 
 
 		 398 aa  242  7.999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1951  aromatic amino acid aminotransferase  32.58 
 
 		 396 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0169777  hitchhiker  0.00556928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  31.82 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1921  aromatic amino acid aminotransferase  33 
 
 		 396 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115062  hitchhiker  0.00000000119915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2057  aromatic amino acid aminotransferase  33 
 
 		 396 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131277  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  32.59 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  32.58 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2045  aromatic amino acid aminotransferase  32.24 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201234  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1974  aromatic amino acid aminotransferase  32.75 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00339161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>