21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31452 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_31452  predicted protein  100 
 
 		 599 aa  1248    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  24.71 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  22.96 
 
 		 632 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  23.78 
 
 		 1290 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  21.58 
 
 		 673 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  37.84 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  26.97 
 
 		 450 aa  47.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85825  predicted protein  37.68 
 
 		 271 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.312279  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  22.63 
 
 		 732 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  32.5 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04978  pre-RNA splicing factor Srp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10100)  33.33 
 
 		 296 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.740628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  33.73 
 
 		 453 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  34.67 
 
 		 99 aa  45.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  29.89 
 
 		 125 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  32.43 
 
 		 109 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  27.45 
 
 		 122 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3507  predicted protein  29.89 
 
 		 330 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.22649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 		 90 aa  44.3  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40739  predicted protein  40 
 
 		 220 aa  43.9  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.12113 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  34.62 
 
 		 279 aa  43.9  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1121 aa  43.5  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>