18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45969 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45969  predicted protein  100 
 
 
509 aa  1019    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50072  predicted protein  34.23 
 
 
505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.955215  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47781  predicted protein  35.45 
 
 
437 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.938739  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49985  predicted protein  37.35 
 
 
505 aa  216  7e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50146  predicted protein  32.97 
 
 
589 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50071  predicted protein  34.42 
 
 
501 aa  180  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0530284  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48219  predicted protein  29.36 
 
 
480 aa  164  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289088  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48637  predicted protein  28.45 
 
 
551 aa  160  7e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43280  predicted protein  24.2 
 
 
528 aa  117  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0677337  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30899  AAAP family transporter: amino acid  26.65 
 
 
529 aa  90.9  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  22.56 
 
 
555 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  21.61 
 
 
511 aa  64.7  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  25.14 
 
 
449 aa  63.5  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  21.43 
 
 
472 aa  62  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  21.8 
 
 
424 aa  58.2  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  21.36 
 
 
647 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79777  predicted protein  24.2 
 
 
598 aa  50.1  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405101  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49568  predicted protein  25 
 
 
605 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>