73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44610 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44610  uroporphyrinogen-iii synthase  100 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.20099  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_5668  predicted protein  36.82 
 
 
249 aa  132  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00167636 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.04 
 
 
503 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.76 
 
 
511 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.75 
 
 
507 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.51 
 
 
255 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.04 
 
 
507 aa  58.9  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  30 
 
 
513 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  27.9 
 
 
516 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.3 
 
 
260 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.5 
 
 
503 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  26.8 
 
 
250 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.97 
 
 
579 aa  55.8  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01291  putative uroporphyrinogen III synthase  24.85 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.414645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  24.9 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  26.53 
 
 
252 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.73 
 
 
571 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  27.78 
 
 
250 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0065  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.03 
 
 
569 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255039  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  28.28 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6728  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25.78 
 
 
510 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0669  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  26.27 
 
 
567 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  26.19 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.51 
 
 
504 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36060  uroporphyrinogen-III synthase  39 
 
 
347 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.000389625  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  27.27 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.36 
 
 
672 aa  49.7  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  30.07 
 
 
577 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0671  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.81 
 
 
554 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  26.77 
 
 
272 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  24.74 
 
 
250 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10522  uroporphyrin-III C-methyltransferase hemD  29.37 
 
 
565 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0691  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.81 
 
 
554 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0678  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.81 
 
 
554 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.58 
 
 
503 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  31.21 
 
 
513 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.15 
 
 
490 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1399  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.45 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.110691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  26.77 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4360  uroporphyrinogen-III synthase  24.74 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.578422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4695  uroporphyrinogen-III synthase  24.74 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  24.78 
 
 
505 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.47 
 
 
502 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  26.74 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4550  uroporphyrinogen-III synthase  24.74 
 
 
250 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.61 
 
 
528 aa  47  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1376  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.79 
 
 
258 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95913  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0619  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  31.91 
 
 
607 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0627947 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.39 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.37 
 
 
516 aa  46.2  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.77 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1461  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.91 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26181  putative uroporphyrinogen III synthase  29.76 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  24.64 
 
 
211 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.81 
 
 
505 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8324  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.83 
 
 
594 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5697  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.29 
 
 
527 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  21.96 
 
 
493 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  30.34 
 
 
520 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1477  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.47 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0011  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.36 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.458741 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.74 
 
 
508 aa  43.5  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1364  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.49 
 
 
264 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.222114  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.89 
 
 
526 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  38.55 
 
 
558 aa  43.5  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2491  uroporphyrinogen-III synthase  30.56 
 
 
264 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2493  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.44 
 
 
284 aa  43.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0336213  normal  0.207047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.5 
 
 
504 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0920  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  35.11 
 
 
506 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  29.46 
 
 
492 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2985  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.31 
 
 
234 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.202243  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0550  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen- III C-methyltransferase  31.71 
 
 
526 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746354  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  29.46 
 
 
492 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>