More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42902 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42902  predicted protein  100 
 
 		 1343 aa  2774    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49415  predicted protein  35.51 
 
 		 586 aa  289  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  38.2 
 
 		 406 aa  162  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  37.22 
 
 		 395 aa  161  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  37.83 
 
 		 417 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  36.47 
 
 		 435 aa  160  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  40 
 
 		 388 aa  160  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  36.98 
 
 		 401 aa  159  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  37.45 
 
 		 395 aa  159  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  34.29 
 
 		 437 aa  159  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  36.09 
 
 		 435 aa  158  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  34.62 
 
 		 436 aa  157  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  34.62 
 
 		 436 aa  157  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  36.84 
 
 		 395 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  36.84 
 
 		 395 aa  157  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  34.59 
 
 		 394 aa  156  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  36.33 
 
 		 395 aa  156  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  36.74 
 
 		 395 aa  155  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  36.47 
 
 		 395 aa  155  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  36.33 
 
 		 527 aa  154  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  36.33 
 
 		 423 aa  154  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  32.73 
 
 		 433 aa  154  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  36.98 
 
 		 401 aa  153  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 		 397 aa  153  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  37.97 
 
 		 408 aa  152  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  36.33 
 
 		 423 aa  153  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  36.78 
 
 		 402 aa  153  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  36.33 
 
 		 423 aa  153  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  38.67 
 
 		 377 aa  152  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  37.16 
 
 		 423 aa  152  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  35.74 
 
 		 402 aa  151  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  36.54 
 
 		 424 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.22 
 
 		 519 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  34.85 
 
 		 400 aa  149  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  34.85 
 
 		 400 aa  149  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 406 aa  149  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  36.36 
 
 		 400 aa  149  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0399  cobalamin synthesis protein P47K  35.74 
 
 		 441 aa  148  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414566  normal  0.973857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  34.96 
 
 		 470 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  34.96 
 
 		 437 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  34.96 
 
 		 437 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  34.81 
 
 		 540 aa  147  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  36.54 
 
 		 403 aa  147  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  36.54 
 
 		 402 aa  147  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  35.96 
 
 		 394 aa  146  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  33.72 
 
 		 403 aa  146  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  35.07 
 
 		 416 aa  145  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  34.59 
 
 		 402 aa  145  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1955  cobalamin synthesis protein P47K  36.19 
 
 		 392 aa  145  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  34.81 
 
 		 410 aa  145  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  33.08 
 
 		 446 aa  145  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  35.63 
 
 		 407 aa  145  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.83 
 
 		 446 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  35.47 
 
 		 401 aa  144  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  35.74 
 
 		 401 aa  144  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.83 
 
 		 446 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.46 
 
 		 446 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  35.21 
 
 		 422 aa  144  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.83 
 
 		 446 aa  144  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  33.46 
 
 		 446 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  34.67 
 
 		 407 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  35.63 
 
 		 420 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  34.85 
 
 		 438 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  35.61 
 
 		 410 aa  142  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  34.22 
 
 		 415 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2216  cobalamin synthesis protein P47K  27.96 
 
 		 448 aa  142  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  34.47 
 
 		 438 aa  141  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  32.95 
 
 		 415 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  34.48 
 
 		 403 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  32.45 
 
 		 442 aa  140  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  33.46 
 
 		 397 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  34.87 
 
 		 402 aa  139  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  32.84 
 
 		 441 aa  138  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  34.34 
 
 		 402 aa  138  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  34.87 
 
 		 410 aa  138  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  32.33 
 
 		 399 aa  138  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  33.09 
 
 		 404 aa  138  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2626  cobalamin synthesis protein P47K  32.7 
 
 		 395 aa  137  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.53013 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.08 
 
 		 400 aa  137  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  32.83 
 
 		 396 aa  137  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  30.55 
 
 		 423 aa  137  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.08 
 
 		 400 aa  137  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.38 
 
 		 402 aa  137  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  33.46 
 
 		 373 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  35.38 
 
 		 407 aa  137  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.34 
 
 		 403 aa  136  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  32.08 
 
 		 442 aa  136  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  34.35 
 
 		 401 aa  136  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  34.1 
 
 		 401 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  34.09 
 
 		 399 aa  135  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  34.1 
 
 		 402 aa  135  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00170  cobalamin synthesis protein, putative  31.19 
 
 		 563 aa  135  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.488231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  36.08 
 
 		 410 aa  135  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  32.32 
 
 		 401 aa  134  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 		 399 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  33.46 
 
 		 400 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  32.58 
 
 		 401 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  32.67 
 
 		 352 aa  134  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  33.46 
 
 		 402 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  33.46 
 
 		 400 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>