29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37903 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_37903  predicted protein  100 
 
 
293 aa  610  9.999999999999999e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166915  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50348  predicted protein  45.42 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515891  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49826  predicted protein  45.42 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  39.12 
 
 
322 aa  188  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50607  predicted protein  38.02 
 
 
351 aa  162  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1497  hypothetical protein  33.5 
 
 
241 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0111137  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41518  predicted protein  40.54 
 
 
163 aa  87.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  29.74 
 
 
264 aa  79  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  25.89 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  28.86 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1207  hypothetical protein  31.01 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  29.1 
 
 
430 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  27.65 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  29.09 
 
 
234 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  29 
 
 
314 aa  56.2  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  25.22 
 
 
569 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  23.7 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  29.68 
 
 
409 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  24.35 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  23.91 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  23.56 
 
 
784 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  24.76 
 
 
219 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2698  methyltransferase FkbM family  26.67 
 
 
579 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  24.4 
 
 
265 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.18 
 
 
1644 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.18 
 
 
1644 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  25.26 
 
 
785 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2508  hypothetical protein  32.31 
 
 
134 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.661879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  26.75 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>