18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34949 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_34949  predicted protein  100 
 
 
318 aa  661    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27826  predicted protein  35.31 
 
 
354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0179342 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28582  predicted protein  31.64 
 
 
296 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.614483  hitchhiker  0.000000143013 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43573  predicted protein  30.74 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2742  hypothetical protein  30.3 
 
 
231 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.681774  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  27.8 
 
 
246 aa  96.7  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.028666 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45579  predicted protein  27.14 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  29.04 
 
 
227 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0954  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.4 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2900  putative lipase  28.18 
 
 
257 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0286742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1213  putative lipase  27.11 
 
 
237 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.137275 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04171  hypothetical protein  26.86 
 
 
197 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0117581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1000  hypothetical protein  24.59 
 
 
239 aa  55.8  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.621877  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15641  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.29 
 
 
236 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74385 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1277  hypothetical protein  24.58 
 
 
234 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00102442  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1410  hypothetical protein  25.15 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414925  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1504  hypothetical protein  24.19 
 
 
234 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0955  hypothetical protein  22.58 
 
 
251 aa  43.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.486617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>