39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1591 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  746    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  54.78 
 
 
364 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  51.76 
 
 
363 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  56.37 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  53.41 
 
 
362 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  53.16 
 
 
357 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  47.5 
 
 
361 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  47.09 
 
 
362 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  47.09 
 
 
361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  46.78 
 
 
357 aa  339  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  46.2 
 
 
356 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  46.2 
 
 
356 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  46.2 
 
 
356 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  47.25 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  45.92 
 
 
354 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  47.11 
 
 
426 aa  334  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  46.18 
 
 
353 aa  333  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  42.15 
 
 
363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  43.15 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  42.15 
 
 
363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  41.3 
 
 
375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  41.71 
 
 
370 aa  294  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  43.11 
 
 
351 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  41.01 
 
 
355 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  41.43 
 
 
378 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  40.11 
 
 
347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  35.58 
 
 
380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  34.95 
 
 
382 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  44.55 
 
 
245 aa  200  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  37.23 
 
 
281 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  31.58 
 
 
395 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  33.57 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  31.97 
 
 
394 aa  110  5e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  57.14 
 
 
85 aa  96.3  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  28.8 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  29.06 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  30 
 
 
372 aa  59.7  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  22.97 
 
 
268 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  24.58 
 
 
375 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>