42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4604 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  35.85 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  40.24 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  37.75 
 
 		 165 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  34 
 
 		 168 aa  93.6  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  32.45 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  30.32 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  28.85 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  31.01 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  31.01 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4056  CheW protein  26.21 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4018  CheW protein  26.21 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  36.92 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  28.78 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  25.69 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  24.36 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  23.53 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  25.45 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  26.62 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  28.36 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  25.84 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  23.61 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  26.32 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  22.14 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  26.32 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  26.72 
 
 		 152 aa  44.7  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  27.83 
 
 		 139 aa  44.7  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  26.83 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  26.83 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  23.49 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  23.49 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  34.83 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  27.97 
 
 		 331 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  25.69 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  25.44 
 
 		 154 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  21.54 
 
 		 151 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  42.86 
 
 		 189 aa  42  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  22.44 
 
 		 161 aa  41.2  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5451  CheW protein  33.33 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  24.56 
 
 		 154 aa  41.2  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  24.59 
 
 		 146 aa  41.2  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4744  CheW protein  24.5 
 
 		 175 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>