63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2285 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 307 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  69.02 
 
 		 310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  67 
 
 		 328 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  68.35 
 
 		 328 aa  438  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  69.59 
 
 		 303 aa  430  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  67.6 
 
 		 342 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  62.71 
 
 		 380 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  55.02 
 
 		 287 aa  325  7e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  53.12 
 
 		 291 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  43.18 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  46.25 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  43.94 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  42.64 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  41.35 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  41.67 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  30 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  29.25 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  27.59 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  29.69 
 
 		 251 aa  102  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  28.29 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  27.69 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  26.27 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  29.32 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  25.28 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  28.1 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  28.57 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  27.88 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  29.69 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  27.09 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  24.75 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  22.75 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  25.1 
 
 		 258 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  24.56 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  27.9 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  32.17 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  25.37 
 
 		 260 aa  49.3  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  25.95 
 
 		 256 aa  49.3  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  23.67 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  23.86 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  26.35 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  23.48 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  26.99 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3219  hydrolase, TatD family  30.07 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  26.84 
 
 		 256 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  40.74 
 
 		 271 aa  45.8  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  30.46 
 
 		 461 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  25.34 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  25 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  22.8 
 
 		 454 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  31.63 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  23.74 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  23.56 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  23.78 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  25 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  29.14 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  29.32 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  27.95 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  23.78 
 
 		 254 aa  43.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  26.88 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  26.22 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  25.31 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  23.41 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  26.88 
 
 		 260 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>