242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1640 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
624 aa  1287    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  43.43 
 
 
624 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  42.31 
 
 
613 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  40.61 
 
 
620 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  64.05 
 
 
343 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  63.73 
 
 
343 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  63.04 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  62.75 
 
 
318 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  39.27 
 
 
601 aa  405  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  57.64 
 
 
331 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  39.32 
 
 
608 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  55.26 
 
 
343 aa  363  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  44.1 
 
 
425 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  45.18 
 
 
483 aa  329  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  51.03 
 
 
412 aa  313  9e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  54.42 
 
 
331 aa  301  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  47.88 
 
 
338 aa  286  8e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  44.66 
 
 
422 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  47.04 
 
 
418 aa  283  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  48.99 
 
 
305 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  48.99 
 
 
305 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00310  glutaminase  41.15 
 
 
645 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  44.28 
 
 
332 aa  273  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  44.55 
 
 
330 aa  272  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  43.42 
 
 
311 aa  270  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  44.26 
 
 
306 aa  265  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  39.34 
 
 
456 aa  263  6.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  43.97 
 
 
310 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  43.65 
 
 
310 aa  257  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  43.65 
 
 
310 aa  256  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  43.65 
 
 
310 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  43.65 
 
 
310 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  42.68 
 
 
335 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  43.65 
 
 
310 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  43.32 
 
 
310 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  42.68 
 
 
335 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  42.68 
 
 
335 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  43.32 
 
 
310 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  43.32 
 
 
310 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  44.08 
 
 
307 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  43.13 
 
 
434 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  43.42 
 
 
307 aa  249  8e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  49.81 
 
 
317 aa  249  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  42.91 
 
 
307 aa  242  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  42.76 
 
 
331 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  40.66 
 
 
310 aa  237  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  44.59 
 
 
311 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  42.71 
 
 
309 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  43.58 
 
 
311 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  37.83 
 
 
313 aa  232  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  42.47 
 
 
333 aa  231  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  42.36 
 
 
309 aa  230  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  43.92 
 
 
311 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  42.36 
 
 
309 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  42.36 
 
 
309 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  42.36 
 
 
309 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  42.36 
 
 
309 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  42.36 
 
 
309 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  42.36 
 
 
309 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  42.01 
 
 
309 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  42.01 
 
 
309 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  38.05 
 
 
326 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  42.01 
 
 
309 aa  227  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  38.05 
 
 
326 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06680  glutaminase  42.76 
 
 
347 aa  227  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  36.98 
 
 
326 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  36.98 
 
 
326 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  36.98 
 
 
326 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  42.76 
 
 
309 aa  226  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  44.14 
 
 
309 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  36.98 
 
 
326 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  36.66 
 
 
326 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  36.66 
 
 
326 aa  226  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  44.48 
 
 
309 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  40.68 
 
 
308 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  42.07 
 
 
315 aa  220  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  43.09 
 
 
309 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  41.5 
 
 
309 aa  216  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  40 
 
 
307 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  41.61 
 
 
309 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  41.88 
 
 
309 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  40.34 
 
 
306 aa  212  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  41.64 
 
 
309 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  41.45 
 
 
304 aa  210  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  41.45 
 
 
304 aa  210  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  41.98 
 
 
304 aa  210  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  41.98 
 
 
304 aa  210  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  41.45 
 
 
304 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  41.45 
 
 
304 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  41.45 
 
 
304 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  41.45 
 
 
304 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  39.41 
 
 
308 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  41.88 
 
 
309 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  41.88 
 
 
309 aa  208  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  42.11 
 
 
304 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  41.64 
 
 
304 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  40.4 
 
 
306 aa  208  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  40.7 
 
 
304 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  42.11 
 
 
304 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0299  L-glutaminase  43.75 
 
 
308 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0584671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>