31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1510 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
256 aa  507  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.92 
 
 
256 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.69 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.59 
 
 
248 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  45.28 
 
 
284 aa  185  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  43.08 
 
 
278 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  45.7 
 
 
274 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.53 
 
 
286 aa  168  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  38.1 
 
 
297 aa  128  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  35.46 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  37.08 
 
 
300 aa  126  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  37.7 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  36.68 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0153  hypothetical protein  35.29 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  34.65 
 
 
273 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  35.16 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  34.25 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26721  hypothetical protein  38.35 
 
 
300 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  28.4 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.77 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.76 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.88 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.06 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.27 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  25.59 
 
 
285 aa  62.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.09 
 
 
405 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  25.1 
 
 
339 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24 
 
 
386 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.41 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.91 
 
 
364 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.25 
 
 
322 aa  45.4  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>