68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4185 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 		 95 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  87.37 
 
 		 95 aa  176  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  57.45 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  57.45 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  60.22 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  54.26 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  57.45 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  55.32 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  52.69 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  52.69 
 
 		 94 aa  110  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  56.38 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  56.38 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  56.38 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  51.61 
 
 		 94 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  55.91 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  55.32 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  55.79 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  55.91 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  55.32 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  55.79 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  56.38 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  53.19 
 
 		 96 aa  104  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  55.91 
 
 		 93 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  54.26 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  54.26 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  54.26 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  54.26 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  50 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  55.91 
 
 		 93 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.87 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4830  putative stability protein StbE  55.32 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  50 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4701  putative stability protein StbE  57.45 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.86483 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0890  stability protein StbE, putative  47.31 
 
 		 93 aa  91.3  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1012  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.31 
 
 		 93 aa  91.3  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247568  hitchhiker  0.000000000573461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4796  putative stability protein StbE  56.38 
 
 		 94 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.21 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.21 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5387  stability cassette protein, putative  51.06 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4851  putative stability protein StbE  56.38 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.31 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  56.58 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44980  Cytotoxin, RelE protein  50.54 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0244  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.39 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1588  hypothetical protein  53.33 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5358  plasmid stabilization system protein  55.56 
 
 		 72 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5502  plasmid stabilization system protein  55.56 
 
 		 72 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.518192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00613  putative relE protein  50 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.164171  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1119  addiction module toxin, RelE/StbE  56.32 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197659  normal  0.189109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1266  hypothetical protein  55.17 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0704408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1208  plasmid stabilization system protein  47.76 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4264  hypothetical protein  62.5 
 
 		 49 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03534  hypothetical protein  86.11 
 
 		 48 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4228  hypothetical protein  68.29 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3603  prevent-host-death family protein  32.14 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4769  plasmid stabilization system protein  58 
 
 		 50 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  34.94 
 
 		 87 aa  50.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1997  addiction module antitoxin  61.11 
 
 		 37 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.67699  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  28.92 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0387  hypothetical protein  27.38 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  25.32 
 
 		 85 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  30.95 
 
 		 89 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.27 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.38 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  25 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.29 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>