27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59980 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  283  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36340  hypothetical protein  59.32 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  49.56 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  45.8 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  50.88 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  47.79 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  46.15 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  46.15 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  43.2 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  46.9 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  43.2 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  42.11 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0686  protein of unknown function DUF1525  50 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.576261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  37.4 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2183  hypothetical protein  48.72 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2397  hypothetical protein  47.86 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  42.34 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0945  protein of unknown function DUF1525  47.86 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  47.5 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  38.26 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  40.19 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  34.96 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  36.45 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  33.98 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3925  hypothetical protein  29.87 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2754  hypothetical protein  32.65 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>