50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29120 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  721    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  91.41 
 
 		 361 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  70.45 
 
 		 358 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  67.42 
 
 		 356 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  68.54 
 
 		 355 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  66.57 
 
 		 364 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  71.31 
 
 		 357 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  71.59 
 
 		 357 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  71.31 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  70.19 
 
 		 357 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  43.71 
 
 		 357 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  42.26 
 
 		 379 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  37.57 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  33.71 
 
 		 369 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  35.92 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  35.03 
 
 		 413 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  30.45 
 
 		 401 aa  183  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  29.66 
 
 		 376 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  28.49 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  26.78 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  37.78 
 
 		 541 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  37.22 
 
 		 541 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  28.69 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  28.69 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  27 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  26.77 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62650  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1088 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5452  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1088 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.381107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4482  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1002 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  21.13 
 
 		 1124 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  21.49 
 
 		 981 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3550  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1074 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4173  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1009 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0896  putative transmembrane protein  23.47 
 
 		 1261 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198015  normal  0.329843 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00932  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1156 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.697292  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  20.59 
 
 		 978 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  26.53 
 
 		 595 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4816  hypothetical protein  24.22 
 
 		 983 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682777  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  23.4 
 
 		 996 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1502  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1119 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  20.28 
 
 		 978 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0729  hypothetical protein  24.41 
 
 		 978 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0766  protein of unknown function DUF748  23.94 
 
 		 1260 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.172009  normal  0.0206816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  28.18 
 
 		 1235 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0837  protein of unknown function DUF748  23.94 
 
 		 1266 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457856  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1662  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1235 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1563  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1087 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.332771  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  23.62 
 
 		 978 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3628  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1304 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715566  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3951  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1337 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.595385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>