More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_07841 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_07841  putative GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 257 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.987944 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0732  GTP cyclohydrolase  83.19 
 
 		 249 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1631  GTP cyclohydrolase I  74.32 
 
 		 251 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14731  GTP cyclohydrolase I  82.59 
 
 		 248 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0919672 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0536  GTP cyclohydrolase  81.98 
 
 		 246 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05921  putative GTP cyclohydrolase I  81.98 
 
 		 246 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05621  putative GTP cyclohydrolase I  81.53 
 
 		 246 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1027  GTP cyclohydrolase  78.73 
 
 		 248 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18971  GTP cyclohydrolase I  78.28 
 
 		 248 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06001  putative GTP cyclohydrolase I  68.09 
 
 		 248 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4119  GTP cyclohydrolase I  58.26 
 
 		 243 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1301  GTP cyclohydrolase I  56.31 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1830  GTP cyclohydrolase I  54.71 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.043372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3671  GTP cyclohydrolase  51.26 
 
 		 247 aa  264  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.773299  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1074  GTP cyclohydrolase  54.5 
 
 		 243 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0808  GTP cyclohydrolase I  54.91 
 
 		 241 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0879  GTP cyclohydrolase  54.91 
 
 		 241 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.133005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3631  GTP cyclohydrolase  52.84 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0869  GTP cyclohydrolase  55.66 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0295  GTP cyclohydrolase I  51.72 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3990  GTP cyclohydrolase I  53.67 
 
 		 241 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497334  normal  0.07815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1329  GTP cyclohydrolase I  49.6 
 
 		 267 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104361  hitchhiker  0.00333374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5449  GTP cyclohydrolase I  53.67 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0912  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5834  GTP cyclohydrolase I  53.74 
 
 		 243 aa  244  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6263  GTP cyclohydrolase I  56.42 
 
 		 223 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3354  GTP cyclohydrolase  39.89 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  37.57 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3643  GTP cyclohydrolase I  38.18 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0117786  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  35.63 
 
 		 218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  34.47 
 
 		 212 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  37.7 
 
 		 206 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  32.46 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  32.07 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  38.67 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  33.33 
 
 		 217 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  33.33 
 
 		 217 aa  122  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  31.63 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  35.56 
 
 		 188 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  35.16 
 
 		 184 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  35.62 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  37.85 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  37.85 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  37.85 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  38.33 
 
 		 199 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  35.36 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  32.79 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  36.07 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1665  GTP cyclohydrolase  36.84 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.109192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  37.85 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  37.87 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  35.03 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  38.04 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  33.9 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  36.81 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  36.81 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  35.53 
 
 		 211 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  35.53 
 
 		 211 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  38.89 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  35.03 
 
 		 210 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  36.81 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  37.42 
 
 		 211 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  37.34 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  37.34 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  37.34 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  36.81 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  38.12 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  37.34 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  32.62 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  34.78 
 
 		 189 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  32.24 
 
 		 222 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  32.24 
 
 		 222 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  34.95 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  32.24 
 
 		 222 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  32.24 
 
 		 222 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  32.24 
 
 		 222 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  32.58 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  36.81 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  36.81 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  38.42 
 
 		 190 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  36.72 
 
 		 202 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  34.07 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  38.2 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  34.07 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  36.79 
 
 		 193 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  30.98 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  31.52 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  35.71 
 
 		 182 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  33.53 
 
 		 214 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  36.72 
 
 		 202 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  34.41 
 
 		 192 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  37.85 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  36.88 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  32.22 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  33.53 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  33.53 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  33.53 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  33.53 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  36.67 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  31.47 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>