53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_11501 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_11501  putative pfkB family carbohydrate kinase  100 
 
 
289 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.605527  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11491  putative pfkB family carbohydrate kinase  98.27 
 
 
289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0717159  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1055  PfkB family carbohydrate kinase  87.89 
 
 
289 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.18758  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11351  putative pfkB family carbohydrate kinase  71.02 
 
 
289 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12381  putative pfkB family carbohydrate kinase  50.74 
 
 
283 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1813  pfkB family carbohydrate kinase  46.24 
 
 
309 aa  289  3e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1746  pfkB family carbohydrate kinase  47.55 
 
 
288 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11481  putative pfkB family carbohydrate kinase  51.5 
 
 
280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.036183  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0709  putative pfkB family carbohydrate kinase  47.94 
 
 
280 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.19808  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15431  putative pfkB family carbohydrate kinase  47.94 
 
 
280 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.345352  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0526  PfkB domain protein  34.27 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0531  PfkB domain protein  33.87 
 
 
285 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0498  carbohydrate kinase, PfkB  34.68 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1085  PfkB domain protein  35.02 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2912  ribokinase-like domain-containing protein  33.49 
 
 
290 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.140234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  38.16 
 
 
320 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  36.84 
 
 
311 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  23.05 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  34.21 
 
 
313 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  25.18 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  34.21 
 
 
313 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  35.53 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  23.57 
 
 
306 aa  49.3  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  36.36 
 
 
311 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  37.04 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  35.62 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  27.01 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  34.25 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  32.97 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  32.94 
 
 
319 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  29.76 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  22.62 
 
 
303 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  32.97 
 
 
310 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  25.17 
 
 
309 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  21.98 
 
 
305 aa  45.8  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  32.94 
 
 
316 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  25.33 
 
 
316 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  35.71 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  35.16 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2117  PfkB domain protein  25.19 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.496872  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  35.16 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  51.43 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  24.55 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  28.57 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  29.36 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  25 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5595  PfkB domain protein  35.09 
 
 
333 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  24.29 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0098  PfkB  23.65 
 
 
282 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00218841  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  25 
 
 
289 aa  42.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  31.76 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  33.33 
 
 
310 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>