More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03451 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_03451  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
410 aa  846    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.536517  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1687  S-adenosylmethionine synthetase  76.47 
 
 
409 aa  662    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03351  S-adenosylmethionine synthetase  74.57 
 
 
413 aa  642    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1869  S-adenosylmethionine synthetase  79.26 
 
 
408 aa  687    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0466  S-adenosylmethionine synthetase  77.78 
 
 
411 aa  678    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04001  S-adenosylmethionine synthetase  76.72 
 
 
409 aa  665    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.222949 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03361  S-adenosylmethionine synthetase  75.56 
 
 
413 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0317  S-adenosylmethionine synthetase  75.56 
 
 
413 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22181  S-adenosylmethionine synthetase  79.8 
 
 
419 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03441  S-adenosylmethionine synthetase  72.91 
 
 
413 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  69.4 
 
 
417 aa  588  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  68.06 
 
 
421 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1832  S-adenosylmethionine synthetase  67.91 
 
 
422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  67.41 
 
 
420 aa  574  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1858  S-adenosylmethionine synthetase  67.91 
 
 
422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  66.34 
 
 
418 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  64.02 
 
 
420 aa  562  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4838  S-adenosylmethionine synthetase  67.66 
 
 
424 aa  558  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000220213  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  58.78 
 
 
397 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  60 
 
 
396 aa  496  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  61.4 
 
 
395 aa  498  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  60.2 
 
 
403 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  58.39 
 
 
396 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  60.15 
 
 
403 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  58.85 
 
 
395 aa  488  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  59.71 
 
 
396 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  59.61 
 
 
399 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  59.02 
 
 
395 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  57.92 
 
 
405 aa  477  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  59.26 
 
 
397 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  57.95 
 
 
408 aa  477  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  56.19 
 
 
396 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 
399 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 
399 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 
399 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 
399 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  59.11 
 
 
399 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 
399 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 
399 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 
399 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 
399 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  58.19 
 
 
393 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 
399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  58.44 
 
 
402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  56.3 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  58.13 
 
 
398 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  57.64 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  58.13 
 
 
398 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  56.51 
 
 
396 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  56.68 
 
 
398 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  56.3 
 
 
405 aa  461  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  58.44 
 
 
407 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  55.45 
 
 
395 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  57.89 
 
 
400 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  57.36 
 
 
399 aa  456  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  57.07 
 
 
397 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  56.36 
 
 
398 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  55.15 
 
 
405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  57.5 
 
 
395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  56.36 
 
 
398 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  57.64 
 
 
399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  57.67 
 
 
403 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  57.5 
 
 
395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  56.73 
 
 
402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  53.73 
 
 
406 aa  451  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  55.64 
 
 
402 aa  450  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  56.44 
 
 
403 aa  448  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  53.98 
 
 
406 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  55.91 
 
 
397 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 
401 aa  448  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  55.8 
 
 
396 aa  449  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2414  S-adenosylmethionine synthetase  56.93 
 
 
402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295636  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4357  S-adenosylmethionine synthetase  57.18 
 
 
410 aa  445  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808224  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  56.19 
 
 
388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  53.73 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  55.67 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  56.08 
 
 
395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  57.89 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2373  S-adenosylmethionine synthetase  56.93 
 
 
402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  58.48 
 
 
391 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  58.48 
 
 
391 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2420  S-adenosylmethionine synthetase  56.93 
 
 
402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.219199 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 
384 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  55.75 
 
 
384 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  55.75 
 
 
384 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 
383 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 
384 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 
384 aa  441  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 
384 aa  443  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 
384 aa  443  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 
384 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 
383 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 
383 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  55.75 
 
 
384 aa  443  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  55.58 
 
 
397 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  55.47 
 
 
384 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 
383 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 
383 aa  441  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  56.33 
 
 
395 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2670  S-adenosylmethionine synthetase  56.44 
 
 
402 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178907  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>