15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4506 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4506  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  877    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  28.06 
 
 		 403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  30.22 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  28.5 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  28.99 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  26.98 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  28.53 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  27.09 
 
 		 421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  21.88 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  22.63 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  22.31 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  21.76 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  20.17 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  20.33 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  21.63 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>